More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1310 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_90  transposase  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  100 
 
 
267 aa  545  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  99.63 
 
 
271 aa  544  1e-154  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  99.52 
 
 
209 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  99.52 
 
 
209 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  78.95 
 
 
231 aa  387  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  78.95 
 
 
231 aa  387  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  78.95 
 
 
231 aa  387  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  78.95 
 
 
231 aa  387  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  68.73 
 
 
284 aa  383  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  67.05 
 
 
283 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  67.6 
 
 
282 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  62.69 
 
 
289 aa  363  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  62.69 
 
 
289 aa  363  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  62.69 
 
 
289 aa  363  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  62.69 
 
 
289 aa  363  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  62.69 
 
 
289 aa  364  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  66.93 
 
 
286 aa  362  4e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  60.23 
 
 
276 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  58.39 
 
 
309 aa  340  2e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  57.75 
 
 
278 aa  332  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  61.97 
 
 
265 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  64.89 
 
 
240 aa  326  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  64.89 
 
 
240 aa  326  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  64.89 
 
 
240 aa  326  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  58.43 
 
 
278 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  58.04 
 
 
278 aa  325  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  58.44 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  59.05 
 
 
251 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  57.26 
 
 
250 aa  293  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  67.24 
 
 
195 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  67.24 
 
 
195 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  45.04 
 
 
273 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  61.39 
 
 
174 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  61.39 
 
 
174 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1009  transposase  56.91 
 
 
225 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 
345 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 
345 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 
345 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 
345 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 
345 aa  225  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 
345 aa  225  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 
345 aa  225  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 
345 aa  225  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  45.74 
 
 
358 aa  224  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  47.45 
 
 
279 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  47.45 
 
 
279 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  47.45 
 
 
279 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  46.27 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  46.27 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  46.25 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  46.25 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  46.25 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  43.97 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  44.09 
 
 
284 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  44.09 
 
 
284 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  44.09 
 
 
284 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  44.09 
 
 
284 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  44.09 
 
 
284 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  44.09 
 
 
284 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  44.09 
 
 
284 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  44.09 
 
 
284 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  44.49 
 
 
279 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  44.49 
 
 
279 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  44.49 
 
 
279 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  44.49 
 
 
279 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  59.48 
 
 
153 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  44.49 
 
 
279 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  43.7 
 
 
284 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  43.7 
 
 
283 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  44.22 
 
 
260 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  44.22 
 
 
260 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  40.94 
 
 
284 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  40.94 
 
 
284 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  40.94 
 
 
284 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  40.94 
 
 
284 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  41.96 
 
 
285 aa  205  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  41.96 
 
 
285 aa  205  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  44.53 
 
 
297 aa  204  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  39.69 
 
 
275 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  39.69 
 
 
275 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  39.69 
 
 
275 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  39.69 
 
 
275 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0170  transposase B  50 
 
 
227 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000123124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  40.07 
 
 
280 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  40.75 
 
 
274 aa  201  9e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  44.64 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  44.64 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  44.64 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  44.64 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  44.64 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  44.64 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  44.64 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  44.64 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  44.64 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  44.64 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  41.04 
 
 
307 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  40.62 
 
 
274 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  38.52 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0024  integrase core domain protein  40.62 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.73785  normal  0.509225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>