More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3995 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3995  Integrase catalytic region  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  93.23 
 
 		 250 aa  484  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  94.02 
 
 		 278 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  93.63 
 
 		 278 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  90.84 
 
 		 278 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3338  integrase catalytic region  84.06 
 
 		 250 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  68.64 
 
 		 276 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  66.8 
 
 		 240 aa  344  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  66.8 
 
 		 240 aa  344  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  66.8 
 
 		 240 aa  344  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  59.59 
 
 		 284 aa  314  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  64.66 
 
 		 283 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  63.91 
 
 		 282 aa  304  8.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  59.48 
 
 		 267 aa  304  9.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  59.48 
 
 		 267 aa  304  9.000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  59.48 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  62.73 
 
 		 231 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  62.73 
 
 		 231 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  62.73 
 
 		 231 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  62.73 
 
 		 231 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  57.61 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  57.61 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  57.61 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  57.61 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  57.61 
 
 		 289 aa  299  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  56.96 
 
 		 265 aa  296  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  63.04 
 
 		 286 aa  296  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  57.2 
 
 		 309 aa  279  3e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  59.2 
 
 		 209 aa  265  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  59.2 
 
 		 209 aa  265  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  63.79 
 
 		 174 aa  244  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  63.79 
 
 		 174 aa  244  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0441  putative insertion element protein  95.54 
 
 		 111 aa  215  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  62.75 
 
 		 153 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  60 
 
 		 195 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  60 
 
 		 195 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0960  transposase B  43.35 
 
 		 284 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.141184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1724  transposase B  43.35 
 
 		 284 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3886  transposase B  43.35 
 
 		 284 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3883  transposase B  43.35 
 
 		 284 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3814  transposase B  43.35 
 
 		 284 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2707  transposase B  43.35 
 
 		 284 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1549  transposase B  43.35 
 
 		 284 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0092  transposase B  43.35 
 
 		 284 aa  184  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1155  Integrase catalytic region  42.67 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.667808  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1027  Integrase catalytic region  42.67 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3290  Integrase catalytic region  42.67 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1490  Integrase catalytic region  42.67 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00848161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0221  Integrase catalytic region  42.67 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0383  Integrase catalytic region  42.67 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0288014  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0786  transposase B  42.92 
 
 		 284 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0156  transposase B  42.92 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  44.4 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  39.92 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  43.35 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  43.35 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  43.35 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  39.91 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  39.91 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  38.75 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  40.95 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  40.95 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  40.53 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  40.53 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  40.53 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  40.53 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  40.53 
 
 		 272 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 345 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 345 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 345 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 345 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 358 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 345 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 345 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 345 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  39.08 
 
 		 345 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  40.52 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1009  transposase  52.29 
 
 		 225 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0170  transposase B  43.89 
 
 		 227 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000123124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  41.74 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  41.74 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  38.98 
 
 		 275 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  38.98 
 
 		 275 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  38.98 
 
 		 275 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  38.98 
 
 		 275 aa  165  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  38.26 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  40.09 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  40.09 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  39.57 
 
 		 284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  38.26 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>