188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0991 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  100 
 
 
355 aa  725    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  92.96 
 
 
355 aa  680    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  38.06 
 
 
355 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  43.01 
 
 
368 aa  222  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  37.78 
 
 
355 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  41.26 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  38.06 
 
 
355 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  37.36 
 
 
355 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  36.52 
 
 
355 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  42.33 
 
 
368 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  40.25 
 
 
368 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  40.91 
 
 
368 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  39.32 
 
 
356 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  39.63 
 
 
368 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  41.92 
 
 
370 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  33.53 
 
 
355 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  40.86 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  36.44 
 
 
357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  41.6 
 
 
395 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  36.84 
 
 
347 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  29.38 
 
 
355 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2977  hypothetical protein  98.72 
 
 
78 aa  158  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0737357  hitchhiker  0.00116349 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  35.89 
 
 
303 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  34.25 
 
 
341 aa  153  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  39.53 
 
 
359 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  34.02 
 
 
341 aa  149  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  31.27 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  39.63 
 
 
235 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  31.96 
 
 
350 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  37.5 
 
 
296 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  28.24 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  40.41 
 
 
182 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  45.45 
 
 
252 aa  125  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  40 
 
 
185 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  32.39 
 
 
181 aa  112  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  32.39 
 
 
197 aa  112  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  38.1 
 
 
173 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  39.86 
 
 
316 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  40.43 
 
 
214 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  37.43 
 
 
214 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  31.07 
 
 
196 aa  89.7  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  39.34 
 
 
130 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  41.44 
 
 
147 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  25.48 
 
 
362 aa  86.3  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  50 
 
 
189 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  42.17 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  30.63 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  41.44 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1088  hypothetical protein  96.97 
 
 
362 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  39.25 
 
 
106 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  31.17 
 
 
161 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  31.25 
 
 
143 aa  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  40.86 
 
 
94 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  38.71 
 
 
96 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  31.16 
 
 
153 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  31.16 
 
 
153 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  43.24 
 
 
198 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  41.18 
 
 
172 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2409  Integrase catalytic region  25.78 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359193  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  24.14 
 
 
381 aa  57.4  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3658  Integrase catalytic region  26.49 
 
 
383 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  24.19 
 
 
374 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  24.05 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  24.05 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  24.05 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  24.05 
 
 
381 aa  56.2  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  24.05 
 
 
381 aa  56.2  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  24.05 
 
 
381 aa  56.2  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0729  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00154402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1779  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
378 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1541  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000437148  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1564  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1159  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
358 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.565735  decreased coverage  0.00186464 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  24.62 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0896  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
359 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.366884  normal  0.0325311 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1152  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1071  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000428907  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0891  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
379 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.233948  normal  0.0447709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0876  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.506232 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2429  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
366 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2691  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
390 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149975  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2491  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0709755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0455  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
371 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.664001 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1990  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0292285  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2064  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
365 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
371 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0711  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
359 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000332452  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0721  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208316  decreased coverage  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1497  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
355 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  hitchhiker  0.000449962 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2719  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
356 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00913617  normal  0.77965 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
411 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0088  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1394  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0489416 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3517  hypothetical protein  25.18 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
373 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1978  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
360 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.392869  normal  0.284491 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2198  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
364 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  24.62 
 
 
409 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1702  Integrase catalytic region  25.18 
 
 
364 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.431472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>