23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1088 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1088  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  717    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0732  hypothetical protein  89.47 
 
 
114 aa  135  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244536  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0678  hypothetical protein  85.53 
 
 
114 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2823  hypothetical protein  88.16 
 
 
114 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321965  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2894  hypothetical protein  88.16 
 
 
114 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00688083  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0796  hypothetical protein  85.53 
 
 
114 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0578  hypothetical protein  87.84 
 
 
114 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00393469  normal  0.90948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2988  hypothetical protein  85.53 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0921617  normal  0.0147191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0872  hypothetical protein  92.11 
 
 
116 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0927  hypothetical protein  89.47 
 
 
114 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.245551  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0982  hypothetical protein  88.16 
 
 
115 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.3385  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0999  hypothetical protein  92.11 
 
 
114 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2920  hypothetical protein  92.11 
 
 
114 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1223  hypothetical protein  83.78 
 
 
113 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652229  hitchhiker  0.00272153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0569  hypothetical protein  81.58 
 
 
114 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.562569 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0575  hypothetical protein  86.79 
 
 
91 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00942613  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1090  hypothetical protein  97.67 
 
 
83 aa  90.5  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1189  hypothetical protein  87.5 
 
 
86 aa  89.7  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2977  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0737357  hitchhiker  0.00116349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  96.97 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  96.97 
 
 
355 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1054  hypothetical protein  87.88 
 
 
83 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00344486  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5672  FHA domain containing protein  52.63 
 
 
258 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0631654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>