106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1367 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  100 
 
 		 197 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  100 
 
 		 181 aa  381  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  89.77 
 
 		 355 aa  343  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  63.64 
 
 		 355 aa  248  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  40.51 
 
 		 368 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  41.57 
 
 		 368 aa  134  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  40.51 
 
 		 368 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  38.97 
 
 		 368 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  39.33 
 
 		 356 aa  128  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  41.21 
 
 		 368 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  38.78 
 
 		 370 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  39.05 
 
 		 173 aa  121  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  38.2 
 
 		 395 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  32.39 
 
 		 355 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  32.39 
 
 		 355 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 355 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  33.93 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  33.33 
 
 		 299 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  33.53 
 
 		 316 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  32.74 
 
 		 355 aa  104  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  32.14 
 
 		 333 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  32.14 
 
 		 355 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  31.33 
 
 		 359 aa  98.2  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  30.36 
 
 		 355 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  31.71 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  33.58 
 
 		 303 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  31.55 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  30.49 
 
 		 355 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  31.74 
 
 		 357 aa  96.3  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  33.52 
 
 		 347 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  36.97 
 
 		 130 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  44.05 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  32.97 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  30.73 
 
 		 341 aa  75.5  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  30.73 
 
 		 341 aa  75.1  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  34.34 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  27.07 
 
 		 364 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  31.28 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  37.89 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  28.43 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  38.46 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  29.59 
 
 		 342 aa  61.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  29.79 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  29.79 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  32.29 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  31.76 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  31.76 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  31.76 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0441  transposase  31.76 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.649534  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1236  putative insertion element protein  31.76 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.061183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  27.78 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  31.07 
 
 		 106 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2522  Integrase catalytic region  29.41 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.898977  normal  0.732387 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0638  integrase catalytic subunit  30.43 
 
 		 272 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0109  integrase catalytic subunit  27.18 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2021  integrase catalytic subunit  27.18 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2783  integrase catalytic subunit  27.18 
 
 		 273 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.983973  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0782  hypothetical protein  30.39 
 
 		 138 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4808  transposase B  24.42 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1661  integrase catalytic region  29.41 
 
 		 148 aa  45.1  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.42448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4320  integrase catalytic subunit  29.85 
 
 		 264 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  31.03 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  31.03 
 
 		 290 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  28.24 
 
 		 276 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2777  transposase  38.46 
 
 		 79 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  29.41 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  29.41 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  29.41 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  29.41 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  29.41 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  31.76 
 
 		 265 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  31.76 
 
 		 274 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  29.89 
 
 		 290 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  29.89 
 
 		 290 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3068  transposase B  23.26 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0527  Integrase catalytic region  25.32 
 
 		 349 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  29.41 
 
 		 283 aa  42.4  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  25.95 
 
 		 314 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  25.95 
 
 		 314 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  25.95 
 
 		 314 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  25.95 
 
 		 314 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  25.95 
 
 		 314 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1472  integrase catalytic subunit  25.58 
 
 		 242 aa  42  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.773509  normal  0.0414542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1492  integrase catalytic subunit  25.58 
 
 		 242 aa  42  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1504  integrase catalytic subunit  25.58 
 
 		 242 aa  42  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1944  integrase catalytic subunit  25.58 
 
 		 242 aa  42  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0539  putative transposase  27.59 
 
 		 293 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3307  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 		 272 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1799  hypothetical protein  25 
 
 		 81 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0804  hypothetical protein  33.85 
 
 		 116 aa  42  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4858  integrase catalytic subunit  26.42 
 
 		 282 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2130  integrase catalytic subunit  25 
 
 		 134 aa  41.6  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  25.84 
 
 		 262 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  26.74 
 
 		 372 aa  41.2  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  26.74 
 
 		 372 aa  41.2  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  26.74 
 
 		 372 aa  41.2  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  26.74 
 
 		 372 aa  41.2  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  26.74 
 
 		 372 aa  41.2  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  26.74 
 
 		 372 aa  41.2  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>