More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0478 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  91.27 
 
 		 355 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  89.58 
 
 		 355 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  90.42 
 
 		 355 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  100 
 
 		 355 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  91.55 
 
 		 355 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  89.97 
 
 		 299 aa  547  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  88.93 
 
 		 333 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  69.37 
 
 		 303 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  56.27 
 
 		 357 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  87.74 
 
 		 359 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  85.45 
 
 		 235 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  55.06 
 
 		 368 aa  358  9e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  54.21 
 
 		 368 aa  355  8.999999999999999e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  54.49 
 
 		 356 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  54.78 
 
 		 368 aa  352  7e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  92.31 
 
 		 182 aa  345  6e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  53.93 
 
 		 368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  53.09 
 
 		 368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  52.27 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  57.23 
 
 		 316 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  51.68 
 
 		 370 aa  316  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  84.8 
 
 		 185 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  52.27 
 
 		 342 aa  279  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  92.57 
 
 		 161 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  45.07 
 
 		 347 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  95.8 
 
 		 133 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  37.78 
 
 		 355 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  36.97 
 
 		 355 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  86.61 
 
 		 147 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  53.08 
 
 		 252 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  45.45 
 
 		 296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  36.24 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  55.43 
 
 		 214 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  54.12 
 
 		 173 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  34.02 
 
 		 341 aa  172  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  34.6 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  93.33 
 
 		 236 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  33.14 
 
 		 341 aa  169  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  32.84 
 
 		 350 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  32.76 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  53.5 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  89.61 
 
 		 81 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  27.81 
 
 		 364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  50.96 
 
 		 189 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  89.23 
 
 		 65 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  89.23 
 
 		 65 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  62.5 
 
 		 153 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  75.34 
 
 		 198 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  93.1 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  49.28 
 
 		 130 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  33.33 
 
 		 181 aa  108  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  33.33 
 
 		 197 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  42.96 
 
 		 143 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  98.04 
 
 		 51 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  80.7 
 
 		 98 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  55.56 
 
 		 172 aa  96.3  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  53.76 
 
 		 96 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  51.92 
 
 		 130 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  95.65 
 
 		 54 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  51.61 
 
 		 94 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  36.5 
 
 		 156 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  36.5 
 
 		 156 aa  84.3  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  54.12 
 
 		 120 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3411  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  19.76 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  34.19 
 
 		 171 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  27.93 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  27.93 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  27.93 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  27.93 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  34.55 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  27.93 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  31.47 
 
 		 153 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  31.47 
 
 		 153 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  34.43 
 
 		 185 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4076  hypothetical protein  91.43 
 
 		 70 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  39.22 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0458  integrase catalytic subunit  26.81 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  25.53 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  25.53 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  25.53 
 
 		 309 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0779  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.89745  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  25.53 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0321  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  29.2 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1815  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953859  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3167  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.179309  normal  0.231083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2449  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.708832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  25.63 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  25.63 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  25.63 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0748  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000105818  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2714  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  0.786621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2485  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.151437 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  25.63 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0118  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2677  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.000000537558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1178  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0171  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1238  Integrase catalytic region  27.51 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0115541  normal  0.0835857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>