More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3960 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  100 
 
 		 314 aa  652    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  100 
 
 		 314 aa  652    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  100 
 
 		 314 aa  652    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  99.68 
 
 		 314 aa  650    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  99.68 
 
 		 314 aa  650    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0513  ISBm3, transposase, programmed frameshift  50.94 
 
 		 313 aa  309  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  50.32 
 
 		 315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  50.32 
 
 		 315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  50.32 
 
 		 315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  50.32 
 
 		 315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  50.32 
 
 		 315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  50.32 
 
 		 315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  50.32 
 
 		 315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  50.32 
 
 		 315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  50.32 
 
 		 315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 315 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 315 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 315 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 315 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 315 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 315 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 315 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 315 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  50.16 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  50.16 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  48.1 
 
 		 316 aa  292  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  47.78 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  47.78 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  47.62 
 
 		 316 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  47.47 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  47.47 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0754  integrase catalytic subunit  51.12 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1036  Integrase catalytic region  45.69 
 
 		 318 aa  265  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1133  Integrase catalytic region  45.69 
 
 		 318 aa  265  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0287  Integrase catalytic region  45.69 
 
 		 318 aa  265  8e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  38.67 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1510  integrase catalytic subunit  42.36 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4349  transposase  41.25 
 
 		 329 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.48068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1107  Integrase catalytic region  41.93 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.528266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1813  Integrase catalytic region  41.57 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  39.58 
 
 		 328 aa  216  5e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1120  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 		 358 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1137  integrase catalytic subunit  39.05 
 
 		 358 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1052  integrase catalytic subunit  39.17 
 
 		 358 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1652  integrase catalytic subunit  39.17 
 
 		 358 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1068  integrase catalytic subunit  39.17 
 
 		 358 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  41.14 
 
 		 481 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1255  integrase catalytic subunit  40.99 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2416  integrase catalytic subunit  40.99 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.571149  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1272  integrase catalytic subunit  40.99 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22790  integrase family protein  41.19 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.582156  normal  0.782085 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4313  integrase catalytic subunit  41.39 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0419733  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14260  transposase  36.23 
 
 		 335 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00196593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05300  transposase  36.36 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.374446  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  41.98 
 
 		 422 aa  187  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4011  integrase catalytic subunit  38.01 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2546  integrase catalytic subunit  38.01 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.303835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3937  integrase catalytic subunit  38.01 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2591  integrase catalytic subunit  38.01 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21500  transposase  35.03 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3720  integrase catalytic subunit  37.69 
 
 		 333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3793  integrase catalytic subunit  37.93 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338369  normal  0.128891 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5264  Integrase catalytic region  37.35 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4853  Integrase catalytic region  37.35 
 
 		 330 aa  182  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3083  Integrase catalytic region  37.05 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00428734  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3733  Integrase catalytic region  37.05 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167687  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0788  Integrase catalytic region  37.16 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3687  Integrase catalytic region  35.93 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3283  Integrase catalytic region  35.93 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03170  transposase  35.76 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23770  integrase family protein  36.2 
 
 		 334 aa  175  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1511  integrase catalytic subunit  35.95 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1534  integrase catalytic subunit  35.95 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3273  Integrase catalytic region  35 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0797  Integrase catalytic region  35.42 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1610  Integrase catalytic region  35.12 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0489  transposase  45.83 
 
 		 195 aa  170  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1334  Integrase catalytic region  34.63 
 
 		 335 aa  169  8e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.661987  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11870  transposase  35.18 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0490  transposase  61.17 
 
 		 99 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5614  putative transposase  44.23 
 
 		 208 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.147736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0573  integrase catalytic subunit  28.25 
 
 		 597 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3338  Integrase catalytic region  30.45 
 
 		 380 aa  99  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858997  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7791  Integrase catalytic region  29.69 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.562755  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0520  putative transposase  26.88 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.693676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0341  putative transposase  26.88 
 
 		 327 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  29.18 
 
 		 320 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1525  Integrase catalytic region  30.03 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.88681  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7250  Integrase catalytic region  30.03 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0129  Integrase catalytic region  30.03 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.162314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.07 
 
 		 381 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  30.07 
 
 		 381 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  29.18 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.07 
 
 		 381 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  29.18 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.07 
 
 		 381 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.07 
 
 		 381 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  30.07 
 
 		 381 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  29.74 
 
 		 381 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3594  transposase  29.84 
 
 		 377 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>