More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0804 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0804  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  241  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0782  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  203  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  64.71 
 
 
260 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  59.55 
 
 
309 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  59.55 
 
 
375 aa  104  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  59.55 
 
 
309 aa  105  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  100 
 
 
274 aa  103  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  69.7 
 
 
269 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  58.43 
 
 
309 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  69.7 
 
 
269 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  69.7 
 
 
269 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  69.7 
 
 
269 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1946  integrase catalytic region  59.52 
 
 
298 aa  101  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394231  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  69.7 
 
 
276 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  66.67 
 
 
309 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  61.18 
 
 
309 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  61.18 
 
 
309 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  61.18 
 
 
309 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  59.3 
 
 
309 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  65.22 
 
 
309 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  65.22 
 
 
309 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  65.22 
 
 
309 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  55.06 
 
 
307 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  70.59 
 
 
284 aa  97.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  65.62 
 
 
280 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  67.69 
 
 
309 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  56.52 
 
 
235 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  63.24 
 
 
189 aa  94.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  66.15 
 
 
290 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  63.08 
 
 
279 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  68.75 
 
 
290 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  68.75 
 
 
290 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  70.97 
 
 
273 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  70.97 
 
 
273 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  70.97 
 
 
273 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  70.97 
 
 
273 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  70.97 
 
 
273 aa  94  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1166  integrase catalytic region  66.67 
 
 
223 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  60.23 
 
 
306 aa  93.2  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28750  hypothetical protein  61.54 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000102722  decreased coverage  0.000000000142523 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  65.62 
 
 
372 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  65.62 
 
 
372 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  65.62 
 
 
372 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  68.25 
 
 
290 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  68.25 
 
 
290 aa  92  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  65.62 
 
 
372 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  65.62 
 
 
372 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  65.62 
 
 
372 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  65.62 
 
 
372 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  65.62 
 
 
372 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  65.62 
 
 
372 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  65.62 
 
 
372 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0828  ISRSO14-transposase orfB protein  60.61 
 
 
275 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1492  ISRSO14-transposase orfB protein  60.61 
 
 
275 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0134955  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2405  ISRSO14-transposase orfB protein  60.61 
 
 
275 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1217  ISRSO14-transposase orfB protein  60.61 
 
 
275 aa  90.5  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.350381  normal  0.163604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
276 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
276 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
276 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
276 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4648  integrase catalytic region  59.09 
 
 
211 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0298  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000127276  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0167  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000489876  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  60.87 
 
 
393 aa  90.1  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1483  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
240 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369993  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0152  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
240 aa  90.1  8e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.881638  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0629  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000121323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1746  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0152  A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2513  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.026452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0565  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0644  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.491667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0923  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0979  IS1404 transposase  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1075  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536905  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1250  IS407A, transposase OrfB  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119711  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1472  IS1404 transposase  59.09 
 
 
277 aa  90.1  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>