54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2899 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  294  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  47.45 
 
 
347 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  75.81 
 
 
296 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  42.25 
 
 
299 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  42.96 
 
 
355 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  39.58 
 
 
356 aa  103  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  42.25 
 
 
182 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  42.25 
 
 
316 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  38.89 
 
 
173 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  39.58 
 
 
355 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  41.55 
 
 
355 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  40.85 
 
 
355 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  40.14 
 
 
185 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  37.16 
 
 
368 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  36.11 
 
 
368 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  40.56 
 
 
355 aa  95.9  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  36.81 
 
 
368 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  36.81 
 
 
368 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  39.44 
 
 
333 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  40.43 
 
 
359 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  39.39 
 
 
303 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  42.31 
 
 
368 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  40.14 
 
 
235 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  42.16 
 
 
395 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  40.38 
 
 
370 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  36.55 
 
 
357 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  34.06 
 
 
130 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  39.58 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  41.56 
 
 
172 aa  69.3  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  28.43 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  28.43 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  31.25 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  32.54 
 
 
364 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  31.25 
 
 
355 aa  63.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  33.66 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  43.48 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  25.49 
 
 
355 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  38.71 
 
 
236 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  32.32 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  24.82 
 
 
355 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6848  integrase catalytic subunit  30 
 
 
316 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5566  integrase catalytic region  29.55 
 
 
316 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0200505  normal  0.0677233 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4870  integrase catalytic subunit  29.23 
 
 
316 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3295  integrase catalytic subunit  29.23 
 
 
316 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.102565  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6859  integrase catalytic region  29.23 
 
 
316 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0984063  normal  0.439407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0801  integrase catalytic region  29.23 
 
 
316 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  34.29 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 
341 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  32.95 
 
 
341 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  31.82 
 
 
350 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  31.82 
 
 
341 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  25.93 
 
 
270 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  25.93 
 
 
270 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  25.93 
 
 
270 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>