74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3997 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  451  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  59.63 
 
 
316 aa  215  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  93.33 
 
 
355 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  91.11 
 
 
333 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  87.78 
 
 
355 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  91.11 
 
 
299 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  90 
 
 
182 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  85.56 
 
 
355 aa  164  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  90 
 
 
355 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  90 
 
 
185 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  86.67 
 
 
355 aa  161  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  86.67 
 
 
235 aa  159  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  85.56 
 
 
359 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  89.61 
 
 
303 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  90.54 
 
 
81 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  89.23 
 
 
65 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  89.23 
 
 
65 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  75.41 
 
 
342 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  81.82 
 
 
98 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  52.22 
 
 
96 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  51.11 
 
 
368 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  50 
 
 
368 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  50 
 
 
356 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  51.11 
 
 
173 aa  85.5  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  51.11 
 
 
94 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  51.11 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  49.46 
 
 
357 aa  81.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  46.67 
 
 
368 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  50 
 
 
368 aa  78.6  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  50 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  46.67 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  46.46 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  41.44 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  37.78 
 
 
355 aa  61.6  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  32.22 
 
 
355 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  35.16 
 
 
364 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  34.74 
 
 
355 aa  55.8  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  38.71 
 
 
143 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  38.89 
 
 
106 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  36.05 
 
 
347 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  55.81 
 
 
172 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  27.78 
 
 
197 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  37.78 
 
 
350 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  37.78 
 
 
341 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  27.78 
 
 
181 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  37.78 
 
 
341 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  35 
 
 
276 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  37.93 
 
 
309 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  37.93 
 
 
309 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  37.93 
 
 
309 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  35.05 
 
 
341 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  32.35 
 
 
265 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1971  hypothetical protein  31.33 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  36.21 
 
 
309 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  37.93 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  37.93 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  37.93 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  37.93 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  37.93 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  37.93 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  37.93 
 
 
262 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  37.93 
 
 
309 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  37.93 
 
 
375 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  37.93 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  37.93 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3559  hypothetical protein  31.67 
 
 
174 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  86.96 
 
 
147 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  40.38 
 
 
273 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  40.38 
 
 
273 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  40.38 
 
 
273 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  40.38 
 
 
273 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  40.38 
 
 
273 aa  42.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  37.1 
 
 
270 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3522  hypothetical protein  31.67 
 
 
174 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.585082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>