238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0554 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  100 
 
 
357 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  56.82 
 
 
355 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  56.55 
 
 
355 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  56.27 
 
 
355 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  56.27 
 
 
355 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  55.43 
 
 
355 aa  377  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  49.86 
 
 
356 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  50.42 
 
 
368 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  50.42 
 
 
368 aa  331  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  49.86 
 
 
368 aa  326  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  49.03 
 
 
368 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  54.13 
 
 
299 aa  316  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  48.47 
 
 
368 aa  315  6e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  48.03 
 
 
395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  47.37 
 
 
370 aa  298  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  49.45 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  43.77 
 
 
303 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  38.69 
 
 
347 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  50.47 
 
 
359 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  36.44 
 
 
355 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  48.39 
 
 
235 aa  196  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  35.71 
 
 
355 aa  195  8.000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  55.17 
 
 
173 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  52.69 
 
 
182 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  60 
 
 
161 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  39.37 
 
 
296 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  32.21 
 
 
341 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  33.52 
 
 
341 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  35.06 
 
 
341 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  47.87 
 
 
252 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  32.17 
 
 
355 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  33.9 
 
 
350 aa  170  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  36.26 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  47.7 
 
 
214 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  30.23 
 
 
355 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  47.4 
 
 
185 aa  149  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  61.86 
 
 
133 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  26.68 
 
 
364 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  51.02 
 
 
316 aa  134  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0538  hypothetical protein  55.86 
 
 
147 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  46.45 
 
 
214 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  43.12 
 
 
189 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  47.2 
 
 
130 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  57.83 
 
 
172 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  51 
 
 
96 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  50.53 
 
 
153 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2706  integrase  31.74 
 
 
181 aa  96.7  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1367  integrase  31.74 
 
 
197 aa  96.3  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  49.48 
 
 
94 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2899  hypothetical protein  36.55 
 
 
143 aa  86.3  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.587362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  47.12 
 
 
130 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  22.93 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  49.46 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  35.11 
 
 
156 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  35.11 
 
 
156 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2625  transposase, IS3  34.31 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.016609  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2700  transposase, IS3  34.31 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.423605 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  50.65 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  62.07 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  29.35 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  30.91 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  34.45 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2787  integrase core subunit  38.39 
 
 
106 aa  67.4  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  43.53 
 
 
120 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  46.75 
 
 
81 aa  63.5  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  67.35 
 
 
51 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  65.22 
 
 
54 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  46.38 
 
 
65 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0719  Integrase catalytic region  32.41 
 
 
314 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.499878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3960  Integrase catalytic region  32.41 
 
 
314 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382194  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0361  Integrase catalytic region  32.41 
 
 
314 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1886  Integrase catalytic region  32.41 
 
 
314 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.280908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1887  Integrase catalytic region  32.41 
 
 
314 aa  52.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.282535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1369  integrase catalytic subunit  31.33 
 
 
272 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  44.93 
 
 
65 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4022  Integrase catalytic region  34.06 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500717  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3411  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  22.82 
 
 
348 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  22.82 
 
 
348 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  22.82 
 
 
348 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  22.82 
 
 
348 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0179  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.289983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0485  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0549  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0673  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.946577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1870  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1990  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2137  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2560  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0278482  decreased coverage  0.00231503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2654  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  normal  0.067102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2979  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.161528  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3207  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.249137  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3352  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3394  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3424  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.821983 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3658  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4025  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.404893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4445  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4504  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.23514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4598  integrase catalytic subunit  30.51 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>