54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3831 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  504  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  91.86 
 
 		 368 aa  407  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  91.4 
 
 		 368 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  89.14 
 
 		 368 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  88.24 
 
 		 368 aa  394  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  87.5 
 
 		 368 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  89.62 
 
 		 356 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  88.52 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  82.43 
 
 		 370 aa  360  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  88.02 
 
 		 189 aa  291  5e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  85.37 
 
 		 214 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  54.03 
 
 		 355 aa  203  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  54.03 
 
 		 355 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  53.08 
 
 		 355 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  52.13 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  52.61 
 
 		 355 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  88.57 
 
 		 130 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  53.07 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  47.87 
 
 		 357 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  46.67 
 
 		 347 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  47.25 
 
 		 296 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  89.77 
 
 		 120 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  54.19 
 
 		 299 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  80.9 
 
 		 172 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  50.31 
 
 		 161 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  54.33 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  41.12 
 
 		 355 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  36.13 
 
 		 341 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  45.45 
 
 		 355 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  36.41 
 
 		 341 aa  125  7e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  33.65 
 
 		 341 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  34.07 
 
 		 350 aa  113  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  53.91 
 
 		 133 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  30.57 
 
 		 364 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  34.72 
 
 		 355 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  41.6 
 
 		 156 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  41.6 
 
 		 156 aa  94.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  31.77 
 
 		 355 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  50.52 
 
 		 153 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0484  hypothetical protein  76.79 
 
 		 79 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  43.64 
 
 		 171 aa  86.3  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  36.55 
 
 		 303 aa  85.5  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  39.82 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  38.02 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  50 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  52.24 
 
 		 359 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  49.25 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2293  hypothetical protein  25.58 
 
 		 362 aa  58.5  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  32.87 
 
 		 342 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  75.86 
 
 		 173 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  48.28 
 
 		 412 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  58.7 
 
 		 54 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2306  hypothetical protein  39.53 
 
 		 86 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2898  hypothetical protein  39.53 
 
 		 86 aa  42.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>