56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2696 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  316  7.999999999999999e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  93.42 
 
 		 355 aa  280  7.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  92.57 
 
 		 355 aa  274  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  88.16 
 
 		 355 aa  266  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  89.86 
 
 		 355 aa  265  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  86.49 
 
 		 355 aa  257  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  89.08 
 
 		 133 aa  212  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  60 
 
 		 357 aa  183  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  86.96 
 
 		 299 aa  157  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0496  hypothetical protein  53.29 
 
 		 214 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  50.97 
 
 		 368 aa  138  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  50.97 
 
 		 368 aa  137  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3831  hypothetical protein  50.31 
 
 		 252 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0221462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  50.32 
 
 		 368 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  50.32 
 
 		 368 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  50.32 
 
 		 356 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  50.32 
 
 		 395 aa  133  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  49.68 
 
 		 368 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3430  hypothetical protein  48.1 
 
 		 189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4436  hypothetical protein  52.17 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  46.75 
 
 		 370 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4658  hypothetical protein  61.46 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49301  normal  0.946779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  81.94 
 
 		 303 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  89.66 
 
 		 412 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  59.6 
 
 		 342 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  78.12 
 
 		 333 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  98.04 
 
 		 51 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  43.8 
 
 		 347 aa  95.1  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4465  hypothetical protein  49.04 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4652  hypothetical protein  95.65 
 
 		 54 aa  87.4  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4141  hypothetical protein  41.98 
 
 		 296 aa  87.4  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4397  hypothetical protein  53.93 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.746728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2548  integrase catalytic subunit  35.66 
 
 		 341 aa  84.3  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0665546  normal  0.0623841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2782  integrase catalytic subunit  34.97 
 
 		 341 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.682547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2624  hypothetical protein  36.3 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0319312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2699  hypothetical protein  36.3 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2864  integrase catalytic subunit  34.53 
 
 		 341 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3144  hypothetical protein  52.33 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2959  hypothetical protein  31.82 
 
 		 355 aa  72  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0510943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2551  integrase catalytic subunit  32.35 
 
 		 350 aa  70.9  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  0.0627465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  86.84 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3411  hypothetical protein  63.16 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  31.17 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2786  hypothetical protein  35.25 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.987718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4076  hypothetical protein  90.91 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1295  hypothetical protein  40.48 
 
 		 355 aa  61.2  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4365  hypothetical protein  80.56 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1465  hypothetical protein  80.56 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2627  hypothetical protein  35.23 
 
 		 355 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1131  hypothetical protein  38.46 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.907939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  71.88 
 
 		 198 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2702  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2306  hypothetical protein  44.19 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2898  hypothetical protein  44.19 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3025  integrase catalytic subunit  23.27 
 
 		 364 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2874  hypothetical protein  37.84 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.110212  normal  0.161262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>