More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3342 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3342  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1971  hypothetical protein  56.69 
 
 		 270 aa  292  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0800  hypothetical protein  56.33 
 
 		 281 aa  291  8e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0638  integrase catalytic subunit  55.12 
 
 		 272 aa  291  8e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  56.2 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  56.2 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  56.2 
 
 		 270 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2602  integrase catalytic subunit  55.95 
 
 		 282 aa  289  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.323138 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1079  hypothetical protein  55.51 
 
 		 281 aa  288  8e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4320  integrase catalytic subunit  54.36 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  52.02 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  52.42 
 
 		 262 aa  275  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  52.42 
 
 		 262 aa  275  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  52.42 
 
 		 262 aa  275  5e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  52.02 
 
 		 262 aa  274  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  52.02 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1944  integrase catalytic subunit  55.65 
 
 		 242 aa  269  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1504  integrase catalytic subunit  55.65 
 
 		 242 aa  269  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1492  integrase catalytic subunit  55.65 
 
 		 242 aa  269  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1472  integrase catalytic subunit  55.65 
 
 		 242 aa  269  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.773509  normal  0.0414542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02902  Integrase, catalytic region  50.21 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  52.92 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  52.92 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  52.92 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  52.92 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  52.92 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1138  Integrase catalytic region  54.58 
 
 		 273 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0377026  hitchhiker  0.000000017757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  52.59 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4808  transposase B  56.72 
 
 		 207 aa  249  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3068  transposase B  56.22 
 
 		 207 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  52.49 
 
 		 270 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0637  transposase OrfB  44.53 
 
 		 249 aa  218  7e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.417638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0640  transposase OrfB  44.53 
 
 		 249 aa  218  7e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.263209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0849  transposase OrfB  44.53 
 
 		 249 aa  218  7e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553346 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3953  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4053  integrase catalytic subunit  45.45 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0400  integrase catalytic subunit  45.04 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  44.3 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  44.3 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  44.3 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4025  integrase catalytic subunit  44.9 
 
 		 266 aa  215  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1778  transposase OrfB  43.5 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  44.13 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0618  ISxcd1 transposase  43.85 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3364  ISxcd1 transposase  43.85 
 
 		 266 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0965  ISSod2, transposase OrfB  44.3 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2160  ISSod2, transposase OrfB  44.3 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4269  ISSod2, transposase OrfB  44.3 
 
 		 271 aa  203  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2897  ISxcd1 transposase  47.55 
 
 		 209 aa  203  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3451  integrase catalytic subunit  40.57 
 
 		 248 aa  201  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2857  integrase catalytic subunit  40.57 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000284719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3960  integrase catalytic subunit  40.57 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  42.86 
 
 		 362 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  42.86 
 
 		 362 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  42.86 
 
 		 362 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  39.67 
 
 		 282 aa  186  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  39.67 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  39.27 
 
 		 274 aa  183  3e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  37.45 
 
 		 281 aa  181  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  39.91 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  39.91 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  37.4 
 
 		 277 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  39.91 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  36.11 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  39.81 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0167  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0531  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1522  A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0026  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0068  IS1404 transposase  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0117  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0159  IS1404 transposase  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0406  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0471  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0565  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0644  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.491667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0736  IS407A, transposase OrfB  37.4 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>