More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02902 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02902  Integrase, catalytic region  100 
 
 		 267 aa  557  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0638  integrase catalytic subunit  55.78 
 
 		 272 aa  299  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2602  integrase catalytic subunit  53.01 
 
 		 282 aa  279  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.323138 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  51.37 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  51.37 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  51.37 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  54.62 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  54.22 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  54.22 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  54.22 
 
 		 262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  54.22 
 
 		 262 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  54.22 
 
 		 262 aa  271  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3342  hypothetical protein  50.21 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0800  hypothetical protein  48.68 
 
 		 281 aa  261  6.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1079  hypothetical protein  48.68 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1971  hypothetical protein  51.39 
 
 		 270 aa  256  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4320  integrase catalytic subunit  48.02 
 
 		 264 aa  253  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1138  Integrase catalytic region  50.57 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0377026  hitchhiker  0.000000017757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  48.67 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  48.46 
 
 		 270 aa  248  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  45.28 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  45.28 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  45.28 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  45.28 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  45.28 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1492  integrase catalytic subunit  47.08 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1472  integrase catalytic subunit  47.08 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.773509  normal  0.0414542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1944  integrase catalytic subunit  47.08 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1504  integrase catalytic subunit  47.08 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4808  transposase B  54.45 
 
 		 207 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3068  transposase B  53.93 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2857  integrase catalytic subunit  44.7 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000284719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3960  integrase catalytic subunit  44.7 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3953  integrase catalytic subunit  45.02 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4053  integrase catalytic subunit  45.02 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0400  integrase catalytic subunit  44.62 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3451  integrase catalytic subunit  45.61 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0965  ISSod2, transposase OrfB  40.38 
 
 		 271 aa  204  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2160  ISSod2, transposase OrfB  40.38 
 
 		 271 aa  204  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4269  ISSod2, transposase OrfB  40.38 
 
 		 271 aa  204  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1778  transposase OrfB  43.08 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  42.63 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4025  integrase catalytic subunit  43.78 
 
 		 266 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  43.53 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0618  ISxcd1 transposase  40.8 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3364  ISxcd1 transposase  40.8 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0637  transposase OrfB  43.09 
 
 		 249 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.417638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0640  transposase OrfB  43.09 
 
 		 249 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.263209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0849  transposase OrfB  43.09 
 
 		 249 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553346 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  40.75 
 
 		 362 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  40.75 
 
 		 362 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  40.75 
 
 		 362 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  41.27 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2897  ISxcd1 transposase  44.28 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  38.58 
 
 		 282 aa  185  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  38.58 
 
 		 282 aa  185  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  40.38 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  39.25 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  40.93 
 
 		 269 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  39.61 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  39.61 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  39.27 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  39.27 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  39.27 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  39.27 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  39.27 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  39.27 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  39.27 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  39.27 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  39.27 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  39.27 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  40.54 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  37.5 
 
 		 269 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  40.23 
 
 		 280 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  42.07 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  38.71 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  38.49 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  38.49 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  40.15 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  38.49 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  40.15 
 
 		 269 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  38.89 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  38.89 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  42.92 
 
 		 234 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  42.92 
 
 		 234 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0504  ISRSO12-transposase ORFB protein  42.92 
 
 		 234 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  39.47 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  38.89 
 
 		 290 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  38.89 
 
 		 290 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  37.22 
 
 		 307 aa  175  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  38.72 
 
 		 309 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  38.72 
 
 		 309 aa  174  9e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  39.33 
 
 		 309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  39.33 
 
 		 309 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>