More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2543 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4005  Integrase catalytic region  79.29 
 
 		 281 aa  443  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795108  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  55.09 
 
 		 274 aa  315  5e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  50 
 
 		 282 aa  279  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  50 
 
 		 282 aa  278  6e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  52.38 
 
 		 269 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  51.2 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  51.2 
 
 		 260 aa  264  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  48.7 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  49.42 
 
 		 280 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  48.45 
 
 		 279 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  47.41 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  47.41 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  47.41 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  47.41 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  47.76 
 
 		 309 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  47.41 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  47.41 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  47.41 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  47.41 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  47.41 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  47.41 
 
 		 372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  47.47 
 
 		 276 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  48.45 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  46.69 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  46.69 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  46.69 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0105  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0436  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.54183  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0584  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.150361  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0647  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523185  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0811  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0845  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0890  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0918  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.399507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0992  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1005  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1227  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.155788  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1308  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1741  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109295  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1760  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1789  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335799  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2073  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0312  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0097322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0783  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1719  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0006  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.126807  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0043  A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0366  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0269645  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0377  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.246103  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0531  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.603629  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0629  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000121323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0684  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0782  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0964  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.466029  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1243  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1265  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.399396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1345  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1524  A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1610  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1629  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00878015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1734  A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899598  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1746  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1749  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0018  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189028  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0152  A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1522  A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1971  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305138  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2268  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2353  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2432  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2513  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.026452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2665  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0425442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2683  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3020  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3103  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3133  IS407A, transposase OrfB  48.45 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>