More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1236 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  100 
 
 		 270 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  100 
 
 		 270 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  100 
 
 		 270 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2602  integrase catalytic subunit  95.19 
 
 		 282 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.323138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  73.95 
 
 		 262 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  73.95 
 
 		 262 aa  424  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  73.95 
 
 		 262 aa  424  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  73.95 
 
 		 262 aa  424  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  73.95 
 
 		 262 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  73.95 
 
 		 262 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4320  integrase catalytic subunit  64.77 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0800  hypothetical protein  65.04 
 
 		 281 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1079  hypothetical protein  64.66 
 
 		 281 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1971  hypothetical protein  64.44 
 
 		 270 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1138  Integrase catalytic region  60.22 
 
 		 273 aa  332  4e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0377026  hitchhiker  0.000000017757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4808  transposase B  68.59 
 
 		 207 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3342  hypothetical protein  56.2 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1944  integrase catalytic subunit  53.78 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1504  integrase catalytic subunit  53.78 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1492  integrase catalytic subunit  53.78 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1472  integrase catalytic subunit  53.78 
 
 		 242 aa  290  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.773509  normal  0.0414542 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0638  integrase catalytic subunit  51.31 
 
 		 272 aa  289  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  55.16 
 
 		 273 aa  288  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  55.16 
 
 		 273 aa  288  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3068  transposase B  68.06 
 
 		 207 aa  288  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  55.16 
 
 		 273 aa  288  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  55.16 
 
 		 273 aa  288  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  55.16 
 
 		 273 aa  288  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  52.71 
 
 		 270 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  53.36 
 
 		 370 aa  285  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  53.36 
 
 		 370 aa  285  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  53.36 
 
 		 370 aa  285  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  53.36 
 
 		 370 aa  285  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  53.36 
 
 		 370 aa  285  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  53.36 
 
 		 370 aa  285  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  53.36 
 
 		 370 aa  285  5e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02902  Integrase, catalytic region  51.37 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3953  integrase catalytic subunit  50.59 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4053  integrase catalytic subunit  50.59 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0400  integrase catalytic subunit  50.2 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4025  integrase catalytic subunit  52.34 
 
 		 266 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  48.44 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0618  ISxcd1 transposase  48.44 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3364  ISxcd1 transposase  48.44 
 
 		 266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2857  integrase catalytic subunit  48.83 
 
 		 275 aa  248  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000284719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3960  integrase catalytic subunit  48.83 
 
 		 275 aa  248  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  48.62 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  48.62 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  48.62 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3451  integrase catalytic subunit  49.38 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0965  ISSod2, transposase OrfB  47.18 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2160  ISSod2, transposase OrfB  47.18 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4269  ISSod2, transposase OrfB  47.18 
 
 		 271 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1778  transposase OrfB  44.31 
 
 		 288 aa  228  7e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  45 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  45 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  45 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  43.45 
 
 		 282 aa  227  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  40.53 
 
 		 280 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  43.07 
 
 		 282 aa  224  8e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  44.8 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  41.5 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  39.16 
 
 		 279 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0637  transposase OrfB  45.27 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.417638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0640  transposase OrfB  45.27 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.263209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0849  transposase OrfB  45.27 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553346 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  39.77 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2897  ISxcd1 transposase  50.77 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  40.84 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  40.84 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  40.84 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  41.73 
 
 		 277 aa  218  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1522  A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1751  A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.872254  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1783  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1900  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3477  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0023  IS1404 transposase  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0026  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0068  IS1404 transposase  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438744  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0117  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0301  IS1404 transposase  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0406  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0471  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0565  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0644  IS407A, transposase OrfB  41.73 
 
 		 277 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.491667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>