More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3953 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_3953  integrase catalytic subunit  100 
 
 
265 aa  550  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4053  integrase catalytic subunit  100 
 
 
265 aa  550  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0400  integrase catalytic subunit  99.62 
 
 
265 aa  549  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  67.17 
 
 
362 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  67.17 
 
 
362 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  67.17 
 
 
362 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2857  integrase catalytic subunit  66.92 
 
 
275 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000284719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3960  integrase catalytic subunit  66.92 
 
 
275 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  65.04 
 
 
266 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4025  integrase catalytic subunit  65.77 
 
 
266 aa  370  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3451  integrase catalytic subunit  69.42 
 
 
248 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0618  ISxcd1 transposase  62.03 
 
 
266 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3364  ISxcd1 transposase  62.03 
 
 
266 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  60.75 
 
 
362 aa  347  8e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  60.75 
 
 
362 aa  347  9e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  60.75 
 
 
362 aa  347  9e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0965  ISSod2, transposase OrfB  60.08 
 
 
271 aa  332  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2160  ISSod2, transposase OrfB  60.08 
 
 
271 aa  332  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4269  ISSod2, transposase OrfB  60.08 
 
 
271 aa  332  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1778  transposase OrfB  58.24 
 
 
288 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0637  transposase OrfB  58.63 
 
 
249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.417638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0640  transposase OrfB  58.63 
 
 
249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.263209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0849  transposase OrfB  58.63 
 
 
249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.553346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2897  ISxcd1 transposase  64.11 
 
 
209 aa  285  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1971  hypothetical protein  54.84 
 
 
270 aa  270  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0800  hypothetical protein  49.8 
 
 
281 aa  265  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1079  hypothetical protein  49.41 
 
 
281 aa  266  4e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  50.59 
 
 
270 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  50.59 
 
 
270 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  50.59 
 
 
270 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2602  integrase catalytic subunit  50.2 
 
 
282 aa  262  3e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.323138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3762  ISxcd1 transposase  64.84 
 
 
192 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  51.01 
 
 
262 aa  254  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  51.01 
 
 
262 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  51.01 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  51.01 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  51.01 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  51.01 
 
 
262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  67.07 
 
 
492 aa  248  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  67.07 
 
 
399 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3471  hypothetical protein  67.07 
 
 
338 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1492  integrase catalytic subunit  50 
 
 
242 aa  244  9e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.275235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1472  integrase catalytic subunit  50 
 
 
242 aa  244  9e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.773509  normal  0.0414542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1944  integrase catalytic subunit  50 
 
 
242 aa  244  9e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1504  integrase catalytic subunit  50 
 
 
242 aa  244  9e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0638  integrase catalytic subunit  46.33 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4320  integrase catalytic subunit  47.06 
 
 
264 aa  236  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  45.53 
 
 
270 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1801  hypothetical protein  66.04 
 
 
282 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1138  Integrase catalytic region  45.88 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0377026  hitchhiker  0.000000017757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  44.57 
 
 
273 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  44.57 
 
 
273 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  44.57 
 
 
273 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  44.57 
 
 
273 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  44.57 
 
 
273 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4808  transposase B  52.85 
 
 
207 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3342  hypothetical protein  45.45 
 
 
254 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  43.13 
 
 
370 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  43.13 
 
 
370 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  43.13 
 
 
370 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  43.13 
 
 
370 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  43.13 
 
 
370 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  43.13 
 
 
370 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  43.13 
 
 
370 aa  215  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02902  Integrase, catalytic region  45.02 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3068  transposase B  52.33 
 
 
207 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  41.96 
 
 
280 aa  205  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  42.29 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2130  integrase catalytic subunit  65.67 
 
 
134 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.590347 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1379  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1427  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1486  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1522  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.128506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1529  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1560  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000677585  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1647  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1692  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.133485  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1717  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1740  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0828457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3265  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3477  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3523  A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0008  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464552  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0023  IS1404 transposase  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0159  IS1404 transposase  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0183  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.295304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0263  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0587266  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0301  IS1404 transposase  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0406  IS407A, transposase OrfB  40.16 
 
 
277 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.803611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>