More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0447 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0447  aldo/keto reductase  100 
 
 
412 aa  838    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0272  aldo/keto reductase  45.42 
 
 
322 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1922  aldo/keto reductase  46.32 
 
 
316 aa  265  8e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3006  aldo/keto reductase  45.16 
 
 
319 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.314963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3434  pyridoxal 4-dehydrogenase  46.23 
 
 
323 aa  261  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0581734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4422  aldo/keto reductase  45.21 
 
 
323 aa  256  7e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000370601  normal  0.543562 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3459  aldo/keto reductase  45.83 
 
 
325 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.221025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2224  aldo/keto reductase  42.48 
 
 
326 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1461  Pyridoxal 4-dehydrogenase  34.16 
 
 
313 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.386468  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1416  aldo/keto reductase  32.03 
 
 
309 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0357  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.68 
 
 
352 aa  119  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5096  aldo/keto reductase  30.56 
 
 
308 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00292864  normal  0.179601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  93.1 
 
 
355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  93.1 
 
 
355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6915  Pyridoxal 4-dehydrogenase  28.57 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0866383  normal  0.474905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  91.38 
 
 
355 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00660  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  29.84 
 
 
373 aa  113  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  91.38 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6096  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  26.13 
 
 
343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4472  hypothetical protein  89.66 
 
 
133 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1596  aldo/keto reductase  32.67 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal  0.769261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2696  hypothetical protein  89.66 
 
 
161 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  89.66 
 
 
355 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2190  putative aldo/keto oxidoreductase  27.08 
 
 
338 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  hitchhiker  0.00616653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0238  aldo/keto reductase  29.63 
 
 
334 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1609  aldo/keto reductase  29.7 
 
 
334 aa  109  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.333452  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0369  aldo/keto reductase  29.02 
 
 
332 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.811379  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1995  aldo/keto reductase  29.18 
 
 
341 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0351  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  29.18 
 
 
354 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  29.14 
 
 
323 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3188  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  25.76 
 
 
336 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0396  aldo/keto reductase  34.78 
 
 
309 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.625327  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6327  pyridoxal 4-dehydrogenase  26.73 
 
 
338 aa  107  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.459761 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3441  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.45 
 
 
336 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3152  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.34 
 
 
299 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1823  putative aldo/keto reductase  30.19 
 
 
328 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3210  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.45 
 
 
336 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.581444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3463  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.45 
 
 
336 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.580843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3429  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.45 
 
 
336 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05370  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  32.19 
 
 
328 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4297  pyridoxal 4-dehydrogenase  26.65 
 
 
346 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.962411 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3116  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  25.15 
 
 
336 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674953  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4072  Pyridoxal 4-dehydrogenase  32.01 
 
 
334 aa  103  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.354561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3523  aldo/keto reductase  27.36 
 
 
340 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292973  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03262  oxidoreductase  26.81 
 
 
348 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4717  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.08 
 
 
336 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5079  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.08 
 
 
336 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4195  Pyridoxal 4-dehydrogenase  33.03 
 
 
345 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0945  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.96 
 
 
341 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.3644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0846  aldo/keto reductase  26.06 
 
 
339 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559318  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1187  aldo/keto reductase  30.86 
 
 
333 aa  100  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.274889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0799  aldo/keto reductase  27.37 
 
 
312 aa  99.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.601126  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1225  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
338 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6342  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.61 
 
 
339 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173988  normal  0.700637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0153  Pyridoxal 4-dehydrogenase  27.46 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0408044  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3410  hypothetical protein  90.2 
 
 
51 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.561039  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4190  Pyridoxal 4-dehydrogenase  26.13 
 
 
338 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0161773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2959  putative aldo/keto reductase family protein  27.71 
 
 
346 aa  96.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1251  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.97 
 
 
323 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2212  aldo/keto reductase  27.27 
 
 
334 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6312  pyridoxal 4-dehydrogenase  28.31 
 
 
338 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5474  Pyridoxal 4-dehydrogenase  28.12 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6471  aldo/keto reductase  28.01 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217137  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33900  Aldo/Keto reductase with a Twin-arginine translocation pathway signal  28.62 
 
 
378 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0159  Pyridoxal 4-dehydrogenase  26.71 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00969615  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31498  predicted protein  27.47 
 
 
356 aa  94.7  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.532767  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6706  aldo/keto reductase  28.01 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.167828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2031  pyridoxal 4-dehydrogenase  24.92 
 
 
336 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5131  oxidoreductase  26.32 
 
 
334 aa  92.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2433  aldo/keto reductase  28.66 
 
 
329 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0536  aldo/keto reductase  28.37 
 
 
291 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5706  aldo/keto reductase  25.69 
 
 
339 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  26.62 
 
 
327 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6070  aldo/keto reductase  25.69 
 
 
339 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.734568  normal  0.816383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  85.42 
 
 
303 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6554  pyridoxal 4-dehydrogenase  25.69 
 
 
339 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.712011 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5300  pyridoxal 4-dehydrogenase  27.57 
 
 
334 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.180992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1422  aldo/keto reductase  26.4 
 
 
317 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0762  Pyridoxal 4-dehydrogenase  28.75 
 
 
321 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4755  aldo/keto reductase  27.24 
 
 
334 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.856524  normal  0.741595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1547  pyridoxal 4-dehydrogenase  30.25 
 
 
348 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.977746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  23.87 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4948  aldo/keto reductase  26.97 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0576267  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2111  aldo/keto reductase  23.93 
 
 
340 aa  86.7  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.550176  normal  0.711591 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.94 
 
 
311 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3226  pyridoxal 4-dehydrogenase  25.55 
 
 
339 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  27.03 
 
 
327 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1060  pyridoxal 4-dehydrogenase  25.08 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8210  oxidoreductase  30.04 
 
 
314 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  22.39 
 
 
327 aa  83.2  0.000000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  25.9 
 
 
326 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  25.9 
 
 
326 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.9 
 
 
326 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  25.9 
 
 
326 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.9 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3390  aldo/keto reductase  25.62 
 
 
322 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.404506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  26.8 
 
 
376 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  23.83 
 
 
311 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  26.67 
 
 
319 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>