34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4374 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4374  putative transposase  100 
 
 
65 aa  133  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3084  hypothetical protein  92.31 
 
 
316 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4653  integrase catalytic region  89.23 
 
 
182 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3035  integrase catalytic region  87.69 
 
 
355 aa  126  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0478  integrase catalytic region  89.23 
 
 
355 aa  126  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0489  putative transposase  87.69 
 
 
81 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3997  hypothetical protein  89.23 
 
 
236 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.630456  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7014  integrase catalytic region  86.15 
 
 
333 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6713  integrase catalytic region  86.15 
 
 
355 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3409  integrase catalytic region  86.15 
 
 
299 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.603508  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0485  integrase catalytic region  85.94 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.444951  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6717  integrase catalytic region  83.08 
 
 
235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0474  integrase catalytic region  84.62 
 
 
355 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3099  putative transposase  84.62 
 
 
65 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541357  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0419  integrase  86.15 
 
 
185 aa  118  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.68554  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0469  integrase catalytic region  81.54 
 
 
355 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4409  integrase catalytic region  94.34 
 
 
303 aa  104  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4390  hypothetical protein  80.43 
 
 
98 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0499  putative transposase  47.69 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0402  integrase catalytic region  47.69 
 
 
368 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591562  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0441  integrase catalytic region  46.15 
 
 
368 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4622  hypothetical protein  75 
 
 
342 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3264  integrase catalytic region  43.08 
 
 
356 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4464  integrase catalytic region  46.15 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3414  integrase catalytic region  47.69 
 
 
368 aa  55.1  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0554  Integrase catalytic region  46.38 
 
 
357 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402049  hitchhiker  0.00292352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3830  putative transposase  47.69 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1404  integrase catalytic region  46.15 
 
 
368 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.731191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3039  integrase catalytic region  47.69 
 
 
368 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3838  integrase catalytic region  47.69 
 
 
370 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0495  putative transposase  40.54 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4376  integrase catalytic region  41.54 
 
 
395 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0991  hypothetical protein  39.06 
 
 
355 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698846  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0519  Integrase catalytic region  40.32 
 
 
347 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.736409  normal  0.299528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>