More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0558 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  100 
 
 		 280 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1628  ISRSO16-transposase ORFB protein  87.55 
 
 		 269 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  62.8 
 
 		 260 aa  314  9e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  62.8 
 
 		 260 aa  314  9e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3838  Integrase catalytic region  59.06 
 
 		 272 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6171  Integrase catalytic region  59.06 
 
 		 272 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2286  Integrase catalytic region  59.06 
 
 		 272 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.102637  hitchhiker  0.00753929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2277  Integrase catalytic region  59.06 
 
 		 272 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000868543  normal  0.0420034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0124  Integrase catalytic region  59.06 
 
 		 272 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  57.62 
 
 		 305 aa  305  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  57.62 
 
 		 305 aa  305  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0094  integrase core subunit  54.83 
 
 		 269 aa  294  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.445692 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0133  transposase B  54.83 
 
 		 269 aa  292  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0067  integrase catalytic region  57.55 
 
 		 251 aa  291  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1439  ISRSO12-transposase ORFB protein  61.21 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2706  ISRSO12-transposase ORFB protein  61.21 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.147887 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0504  ISRSO12-transposase ORFB protein  61.21 
 
 		 234 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  56.73 
 
 		 251 aa  286  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1432  Integrase catalytic region  54.51 
 
 		 269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4739  integrase catalytic region  52.92 
 
 		 279 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0441  integrase catalytic region  52.92 
 
 		 279 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.110873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6105  integrase catalytic region  52.92 
 
 		 279 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2926  integrase catalytic region  52.92 
 
 		 279 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2633  integrase catalytic region  52.92 
 
 		 279 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4858  integrase catalytic subunit  52.43 
 
 		 282 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3307  integrase catalytic subunit  52.43 
 
 		 272 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4236  integrase catalytic region  52.43 
 
 		 282 aa  280  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179979  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  49.62 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3126  integrase catalytic subunit  49.61 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3247  integrase catalytic subunit  49.61 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00558432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3535  integrase catalytic subunit  49.61 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.323423  normal  0.557897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2970  integrase catalytic subunit  49.61 
 
 		 265 aa  261  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0996434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  47.67 
 
 		 276 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  50 
 
 		 274 aa  249  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0138  integrase catalytic subunit  46.51 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1484  integrase catalytic subunit  46.51 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2821  integrase catalytic subunit  46.51 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1301  integrase catalytic subunit  46.12 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0958  integrase catalytic region  48.75 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  47.86 
 
 		 280 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4719  integrase catalytic region  46.44 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.557613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0167  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  47.29 
 
 		 280 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1625  remnant of ISRSO16-transposase ORFB protein  86.67 
 
 		 215 aa  242  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1077  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2087  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.879853  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2268  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.471662  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2283  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2120  A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0751  A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2145  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0578  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00042542  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0978  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.43017  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1313  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336446  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0188  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0908748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0156  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0283  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.010372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0043  A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0195  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.434557  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0291  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0238689  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0366  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0269645  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1243  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1265  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.399396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1457  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1629  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00878015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1734  A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.899598  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1746  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1749  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0461375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0058  A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859906  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0152  A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177961  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0450  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0545  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0617  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.922195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0687  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0709  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0823  A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0938  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0452781  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0960  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.323661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0984  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.756102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0999  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1196  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00667486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1267  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1323  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2513  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.026452  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2585  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2637  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2640  A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2683  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2820  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.670832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2841  A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375956  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2852  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2900  A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3020  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3069  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3103  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.309951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3265  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3298  A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3409  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3477  IS407A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3523  A, transposase OrfB  46.07 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>