More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1854 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1854  integrase catalytic subunit  100 
 
 
189 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.578694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0428  transposase  56.68 
 
 
277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0288  transposase  55.61 
 
 
277 aa  225  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1244  ISSdy1, transposase OrfB  56.18 
 
 
259 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00850335  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1229  ISSdy1, transposase OrfB  56.18 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0649083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2222  transposase  51.65 
 
 
270 aa  190  8e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1879  Integrase catalytic region  36.02 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0867  Integrase catalytic region  36.48 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507483  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0871  Integrase catalytic region  36.48 
 
 
288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0548132  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1397  transposase-like  35.8 
 
 
279 aa  111  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102463  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1744  transposase-like  35.8 
 
 
279 aa  111  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.71737  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2872  transposase-like  35.59 
 
 
279 aa  111  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.274716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13740  Integrase catalytic region  35.58 
 
 
277 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000154434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4217  Integrase catalytic region  32.43 
 
 
274 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0771  Integrase catalytic region  32.43 
 
 
274 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  32.73 
 
 
290 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  32.73 
 
 
290 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  32.73 
 
 
290 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  32.73 
 
 
290 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  32.73 
 
 
290 aa  108  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5316  Integrase catalytic region  30.16 
 
 
297 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3815  Integrase catalytic region  30.16 
 
 
297 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.382453 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3928  Integrase catalytic region  30.16 
 
 
297 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.210808 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5973  transposase catalytic site ISRme3  30.16 
 
 
297 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.291095  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6074  transposase catalytic site ISRme3  30.16 
 
 
297 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0031  integrase catalytic subunit  30.16 
 
 
297 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1612  integrase catalytic subunit  30.16 
 
 
297 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853443  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3348  integrase catalytic subunit  30.16 
 
 
297 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3771  transposase catalytic site ISRme3  30.16 
 
 
297 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3942  transposase catalytic site ISRme3  30.16 
 
 
297 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4659  transposase catalytic site ISRme3  30.16 
 
 
297 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.936352  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5452  transposase catalytic site ISRme3  30.16 
 
 
297 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5679  transposase catalytic site ISRme3  30.16 
 
 
297 aa  108  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1896  ISCps9, transposase orfB, truncated  36.91 
 
 
266 aa  107  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1686  ISCps9, transposase orfB  36.91 
 
 
295 aa  107  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2857  ISCps9, transposase orfB  36.91 
 
 
295 aa  107  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0915718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2962  ISCps9, transposase orfB  36.91 
 
 
295 aa  107  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.499915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3122  ISCps9, transposase orfB  36.91 
 
 
295 aa  107  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2557  Integrase catalytic region  34.64 
 
 
274 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2546  Integrase catalytic region  32.43 
 
 
274 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0281  ISMca2, transposase, OrfB  33.33 
 
 
291 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0907  ISMca2, transposase, OrfB  33.33 
 
 
291 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0842  Integrase catalytic region  34.24 
 
 
252 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2848  integrase catalytic subunit  31.74 
 
 
302 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00290  Integrase catalytic region  34.59 
 
 
291 aa  105  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4420  transposase, OrfB  30.34 
 
 
269 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2644  integrase catalytic subunit  30.46 
 
 
289 aa  104  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0116112  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2636  integrase catalytic subunit  34.1 
 
 
373 aa  104  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1844  integrase catalytic subunit  31.76 
 
 
274 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2285  integrase catalytic region  34.55 
 
 
271 aa  104  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1946  integrase catalytic region  34.55 
 
 
271 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2163  integrase catalytic region  34.55 
 
 
271 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0260  Integrase catalytic region  33.14 
 
 
293 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0435  ISEhe3, transposase orfB  29.41 
 
 
270 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0326  ISEhe3, transposase orfB  29.41 
 
 
270 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.148326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2066  ISEhe3, transposase orfB  29.41 
 
 
270 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000480211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4529  ISEhe3, transposase orfB  29.41 
 
 
270 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.313406  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1991  ISEhe3, transposase orfB  29.41 
 
 
270 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291495  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0281  ISEhe3, transposase orfB  29.41 
 
 
270 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1260  ISEhe3, transposase orfB  29.41 
 
 
270 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0300091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0347  ISEhe3, transposase orfB  29.41 
 
 
270 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0715002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0141  ISEhe3, transposase orfB  29.41 
 
 
270 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000861887  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3021  ISEhe3, transposase orfB  29.41 
 
 
270 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000678494  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4892  integrase catalytic region  31.22 
 
 
296 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96486  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2788  ISEhe3, transposase orfB  29.41 
 
 
270 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00739758  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3970  ISEhe3, transposase orfB  29.41 
 
 
270 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000757878  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1536  Integrase catalytic region  33.14 
 
 
293 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  hitchhiker  0.00036326 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1653  Integrase catalytic region  33.14 
 
 
293 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0770327  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4961  integrase catalytic region  31.22 
 
 
296 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.764431  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0578  ISRSO8-transposase orfB protein  30.1 
 
 
296 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1549  ISRSO8-transposase orfB protein  30.1 
 
 
296 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.797187 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2267  ISRSO8-transposase orfB protein  30.1 
 
 
296 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.748248  normal  0.318024 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0548  ISRSO8-transposase orfB protein  30.1 
 
 
296 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0628  Integrase catalytic region  30 
 
 
289 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0824  Integrase catalytic region  33.14 
 
 
293 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.503124  normal  0.225797 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5327  Integrase catalytic region  30 
 
 
289 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5189  Integrase catalytic region  30 
 
 
289 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100014  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1097  Integrase catalytic region  33.14 
 
 
293 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1582  Integrase catalytic region  33.53 
 
 
280 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1705  Integrase catalytic region  33.53 
 
 
280 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0537  transposase orfAB  29.44 
 
 
269 aa  102  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0863  transposase orfAB  29.44 
 
 
269 aa  102  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.200309  normal  0.704725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1453  transposase orfAB  29.44 
 
 
269 aa  102  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.344739 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2892  Integrase catalytic region  33.15 
 
 
274 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3714  Integrase catalytic region  33.15 
 
 
286 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.0904484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0139  Integrase catalytic region  33.53 
 
 
280 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01677  hypothetical protein  30 
 
 
253 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2220  Integrase catalytic region  31.18 
 
 
291 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3179  Integrase catalytic region  31.18 
 
 
291 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3044  ISPsy12, transposase OrfB  29.78 
 
 
281 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1533  Integrase catalytic region  31.18 
 
 
291 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6034  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  31.74 
 
 
288 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0741  integrase catalytic subunit  28.88 
 
 
270 aa  100  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1775  Integrase catalytic region  33.12 
 
 
292 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.565196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0979  Integrase catalytic region  33.12 
 
 
292 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0519  Integrase catalytic region  33.12 
 
 
292 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.377839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0301  Integrase catalytic region  33.12 
 
 
292 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1316  Integrase catalytic region  33.12 
 
 
292 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0550565  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4257  Integrase catalytic region  32.32 
 
 
271 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3810  integrase catalytic subunit  29.82 
 
 
273 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000660644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>