More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3076 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3076  NLP/P60 protein  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2555  NLP/P60 protein  85.38 
 
 		 199 aa  296  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1696  NLP/P60  96.35 
 
 		 302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.033206  normal  0.040245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2750  NLP/P60 protein  90.77 
 
 		 190 aa  243  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  54.29 
 
 		 308 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  55.88 
 
 		 308 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28410  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  55.47 
 
 		 378 aa  139  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3074  NLP/P60 protein  56.9 
 
 		 116 aa  123  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2747  NLP/P60 protein  46.1 
 
 		 327 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.347637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 182 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8582  NLP/P60 protein  49.57 
 
 		 180 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0901428  normal  0.349112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8293  NLP/P60 protein  50 
 
 		 374 aa  108  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.611397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  35.71 
 
 		 394 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  50.43 
 
 		 345 aa  102  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2551  NLP/P60 protein  45.39 
 
 		 331 aa  97.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  49.5 
 
 		 370 aa  97.4  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 284 aa  95.5  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  52.17 
 
 		 374 aa  94.4  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 417 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  44.86 
 
 		 307 aa  93.6  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  46.36 
 
 		 398 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  43.52 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2085  NLP/P60 protein  44.27 
 
 		 447 aa  93.2  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  43.55 
 
 		 453 aa  92  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  44.17 
 
 		 340 aa  91.7  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  49.5 
 
 		 333 aa  91.7  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  41.59 
 
 		 267 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  43.97 
 
 		 388 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 278 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  44.83 
 
 		 334 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  49.5 
 
 		 452 aa  90.5  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.41 
 
 		 332 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  47.9 
 
 		 331 aa  90.1  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  47.12 
 
 		 318 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.12 
 
 		 329 aa  88.6  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  43.86 
 
 		 273 aa  88.6  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 517 aa  88.6  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  49.59 
 
 		 323 aa  88.6  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  42.99 
 
 		 388 aa  88.2  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  47.17 
 
 		 347 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  44.07 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  43.69 
 
 		 1048 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0609  NLP/P60 protein  49.46 
 
 		 495 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00032953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 333 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  40.83 
 
 		 432 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  37.86 
 
 		 337 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  44.35 
 
 		 340 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1440  NLP/P60  43.86 
 
 		 467 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.51506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1458  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 467 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.614878  normal  0.41084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  38.97 
 
 		 265 aa  85.9  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  43.31 
 
 		 438 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  45.05 
 
 		 335 aa  85.9  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  43.36 
 
 		 391 aa  85.5  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5292  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 469 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.308075  normal  0.186714 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5716  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 469 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3656  NLP/P60 protein  43.86 
 
 		 469 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 501 aa  85.1  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  38.14 
 
 		 266 aa  85.1  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  35.85 
 
 		 335 aa  85.1  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  40.65 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  39.81 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0895  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3000  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.487438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  40.29 
 
 		 625 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  39.55 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  45.28 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11507  invasion protein  41.22 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.116745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.41 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4520  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  49.49 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2451  NLP/P60  41.23 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.629046  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 524 aa  83.2  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2496  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2488  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  38.71 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4564  NLP/P60 protein  42.11 
 
 		 467 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.057013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0184  NLP/P60  41.23 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0198  NLP/P60 protein  39.19 
 
 		 458 aa  82.4  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.193606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  48.39 
 
 		 373 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  39.55 
 
 		 298 aa  81.6  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  40.71 
 
 		 368 aa  81.6  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2747  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 478 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.552726  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  45.45 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  35.57 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0781  NLP/P60 protein  37.78 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0889  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  42.72 
 
 		 374 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3326  NLP/P60 protein  40 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0910486  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5720  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3652  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.387493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  44.21 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0902  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3663  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.24038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5288  NLP/P60 protein  43.24 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.181073 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  36.49 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  40 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2839  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.239503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2843  NLP/P60 protein  43.52 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2872  NLP/P60 protein  43.81 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>