270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1680 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1680  putative membrane transport protein  100 
 
 		 836 aa  1537    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.507173  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  44.33 
 
 		 832 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  40 
 
 		 734 aa  451  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3529  MMPL domain protein  40.27 
 
 		 731 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  42.56 
 
 		 723 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2987  MMPL domain-containing protein  39.64 
 
 		 755 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.30542  normal  0.473143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  38.56 
 
 		 728 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3729  MMPL domain-containing protein  37.64 
 
 		 793 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.980503  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3392  MMPL domain-containing protein  38.39 
 
 		 734 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0160817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0551  MMPL domain protein  37.38 
 
 		 737 aa  352  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6914  hypothetical protein  37.29 
 
 		 724 aa  328  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  35.38 
 
 		 735 aa  316  9e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  35.73 
 
 		 735 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  34.5 
 
 		 732 aa  308  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7233  MMPL domain protein  32.66 
 
 		 742 aa  305  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06730  predicted RND superfamily drug exporter  33.5 
 
 		 787 aa  299  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.510668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0993  MMPL domain protein  36.01 
 
 		 734 aa  290  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.740642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  28.81 
 
 		 829 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  28.81 
 
 		 829 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  35.75 
 
 		 729 aa  286  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  32.57 
 
 		 779 aa  285  3.0000000000000004e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  30.7 
 
 		 920 aa  283  1e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0266  MMPL domain protein  33.13 
 
 		 779 aa  280  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0122735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  35.59 
 
 		 772 aa  273  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  35.59 
 
 		 772 aa  273  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  35.59 
 
 		 772 aa  273  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  32.84 
 
 		 752 aa  265  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  32.18 
 
 		 735 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  31.16 
 
 		 909 aa  260  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  30.05 
 
 		 743 aa  260  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  31.14 
 
 		 717 aa  256  9e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3036  MMPL domain protein  32.04 
 
 		 917 aa  254  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.101076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2172  MMPL domain-containing protein  35.24 
 
 		 784 aa  253  7e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  32.23 
 
 		 842 aa  251  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3328  MMPL domain-containing protein  33.29 
 
 		 903 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464441  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  32.11 
 
 		 729 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  32.48 
 
 		 737 aa  249  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3162  MMPL domain protein  34.06 
 
 		 738 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3218  MMPL domain protein  32.31 
 
 		 1002 aa  244  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.702347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  25.87 
 
 		 893 aa  243  7.999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  31.86 
 
 		 854 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1745  MMPL domain protein  36.05 
 
 		 726 aa  238  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  30.49 
 
 		 1382 aa  238  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1953  MMPL domain protein  30.01 
 
 		 760 aa  238  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  33.42 
 
 		 732 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0497  MMPL domain protein  34.84 
 
 		 732 aa  235  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.912444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  33.24 
 
 		 723 aa  235  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.72 
 
 		 704 aa  233  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  31.15 
 
 		 718 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2536  putative membrane transport protein  30.65 
 
 		 807 aa  232  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5740  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 903 aa  231  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670793 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5585  MMPL domain-containing protein  32.08 
 
 		 787 aa  230  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  29.37 
 
 		 758 aa  228  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0651  MMPL domain-containing protein  31.84 
 
 		 876 aa  226  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4989  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  29.54 
 
 		 735 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.92628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  32.05 
 
 		 726 aa  224  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0755  MMPL domain protein  36.05 
 
 		 726 aa  223  8e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383711  hitchhiker  0.00656683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2864  MMPL domain-containing protein  34.41 
 
 		 715 aa  221  6e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.157135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.77 
 
 		 724 aa  218  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  27.77 
 
 		 796 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  32.02 
 
 		 737 aa  213  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3645  MMPL domain-containing protein  33.12 
 
 		 711 aa  213  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4524  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.59 
 
 		 746 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1386  MMPL domain-containing protein  34.29 
 
 		 761 aa  207  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.33888  normal  0.278999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  30.75 
 
 		 714 aa  207  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  29.24 
 
 		 781 aa  205  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1275  MMPL domain-containing protein  32.32 
 
 		 843 aa  203  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  30.15 
 
 		 740 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37220  predicted RND superfamily drug exporter  28.73 
 
 		 791 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18890  hypothetical protein  35.13 
 
 		 1092 aa  194  8e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.145175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1420  MMPL domain-containing protein  33.51 
 
 		 743 aa  194  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.94343  normal  0.0882917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1319  MMPL domain protein  32.47 
 
 		 840 aa  193  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000032846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4116  Cna B domain protein  32.2 
 
 		 1058 aa  188  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  29.22 
 
 		 749 aa  180  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04640  predicted RND superfamily drug exporter  36.59 
 
 		 958 aa  179  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  29.67 
 
 		 978 aa  172  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5635  MMPL domain protein  30.91 
 
 		 734 aa  171  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10204  transmembrane transport protein mmpL11  31.38 
 
 		 966 aa  171  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.801894  normal  0.953206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  30.39 
 
 		 983 aa  170  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  30.39 
 
 		 983 aa  170  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.39 
 
 		 979 aa  170  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  29.75 
 
 		 968 aa  168  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5233  MMPL domain-containing protein  36.12 
 
 		 751 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  28.5 
 
 		 750 aa  160  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  27.49 
 
 		 741 aa  159  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  34.22 
 
 		 741 aa  158  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  30.98 
 
 		 732 aa  156  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  28.53 
 
 		 740 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  37.23 
 
 		 776 aa  151  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  26.98 
 
 		 758 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  29.63 
 
 		 738 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  31.16 
 
 		 717 aa  138  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  28.29 
 
 		 733 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  28.53 
 
 		 770 aa  137  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  28.29 
 
 		 1155 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  30.32 
 
 		 731 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  24.82 
 
 		 730 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  24.82 
 
 		 730 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  24.82 
 
 		 730 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  24.82 
 
 		 730 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>