223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3576 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3576  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1048 aa  2154    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.12 
 
 		 1110 aa  521  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000467672 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3765  helicase domain-containing protein  33.82 
 
 		 1103 aa  466  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  25.15 
 
 		 1055 aa  108  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.32 
 
 		 952 aa  103  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1672  superfamily II helicase-like protein  25.54 
 
 		 1165 aa  99.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.406776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  27.05 
 
 		 905 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  25.61 
 
 		 693 aa  95.5  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4384  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.81 
 
 		 1166 aa  95.5  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0169007  normal  0.744052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1600  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.78 
 
 		 1197 aa  95.1  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.616777  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3630  DEAD/DEAH box helicase-like  26 
 
 		 1173 aa  95.1  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.890362 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0662  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.47 
 
 		 1032 aa  94.4  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.55 
 
 		 1032 aa  93.6  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3053  DEAD/DEAH box helicase-like  25.76 
 
 		 1173 aa  92.8  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.554309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14030  superfamily II RNA helicase  24.42 
 
 		 953 aa  92.4  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00460424  normal  0.326096 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1793  helicase-like protein  24.65 
 
 		 882 aa  90.1  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0319232  normal  0.918397 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0467  superfamily II RNA helicase  27.08 
 
 		 863 aa  90.5  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  24.86 
 
 		 926 aa  89  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12127  ATP-dependent DNA helicase helY  23.79 
 
 		 906 aa  85.1  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.511305 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  26.29 
 
 		 824 aa  83.2  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0793  DEAD/DEAH box helicase  25.32 
 
 		 877 aa  83.6  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.575248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2513  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.34 
 
 		 918 aa  82.4  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.701769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04059  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.49 
 
 		 1085 aa  82  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2007  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.27 
 
 		 1054 aa  82  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.66697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2476  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.34 
 
 		 918 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2521  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.34 
 
 		 918 aa  82  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2375  ATP-dependent helicase, DEAD/DEAH box family  25.27 
 
 		 1054 aa  82  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  24.24 
 
 		 1060 aa  81.6  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  22.74 
 
 		 918 aa  80.9  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1872  DSH domain protein  23.08 
 
 		 952 aa  80.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0864183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  24.69 
 
 		 904 aa  79.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1777  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.72 
 
 		 981 aa  77.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.147105  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.39 
 
 		 996 aa  75.1  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1028  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.39 
 
 		 709 aa  74.3  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2063  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.26 
 
 		 933 aa  73.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.208331  normal  0.0647712 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_805  predicted protein  24.65 
 
 		 1175 aa  73.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.260379  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1206  DSH domain-containing protein  22.78 
 
 		 906 aa  72.8  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.612467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  28.7 
 
 		 729 aa  72  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  30.29 
 
 		 1942 aa  71.2  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0320  DSH domain protein  30 
 
 		 1003 aa  71.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163283 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  40.45 
 
 		 2015 aa  71.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.59 
 
 		 709 aa  70.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  23.83 
 
 		 751 aa  70.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  30.68 
 
 		 1770 aa  68.9  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.69 
 
 		 803 aa  67.8  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  36.96 
 
 		 1767 aa  67.4  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  26.2 
 
 		 998 aa  67.4  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.86 
 
 		 800 aa  67  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3369  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.88 
 
 		 843 aa  67  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.45 
 
 		 694 aa  67  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  26.46 
 
 		 933 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  25.87 
 
 		 1068 aa  66.2  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.37 
 
 		 799 aa  65.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  20.95 
 
 		 807 aa  65.5  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1286  DSH domain protein  27.41 
 
 		 967 aa  65.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1315  DSH domain protein  27.41 
 
 		 967 aa  65.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.34 
 
 		 700 aa  65.5  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.4 
 
 		 785 aa  65.1  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  41.57 
 
 		 908 aa  64.7  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06007  DEAD/DEAH box RNA helicase (Ski2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10000)  42.22 
 
 		 1293 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542014  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04412  ATP dependent RNA helicase (Dob1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07160)  25.35 
 
 		 1073 aa  64.3  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  26.24 
 
 		 1068 aa  64.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  41.57 
 
 		 908 aa  64.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  41.57 
 
 		 908 aa  64.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  42.7 
 
 		 908 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  23.89 
 
 		 874 aa  64.3  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.87 
 
 		 791 aa  63.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  35.48 
 
 		 2111 aa  63.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.57 
 
 		 927 aa  62.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.12 
 
 		 739 aa  63.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2042  DEAD/DEAH box helicase-like  41.49 
 
 		 924 aa  62.4  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  29.32 
 
 		 890 aa  62.4  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  30.22 
 
 		 2189 aa  62.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  43.3 
 
 		 893 aa  62.4  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  40.45 
 
 		 927 aa  62.4  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04601  putative DNA helicase  29.38 
 
 		 924 aa  62  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.35 
 
 		 856 aa  61.6  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00467654  normal  0.444529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.49 
 
 		 1064 aa  61.6  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0686231  normal  0.184545 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  23.31 
 
 		 1465 aa  61.6  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85287  predicted protein  35.45 
 
 		 1239 aa  61.2  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.793183 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  37.78 
 
 		 1710 aa  60.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02710  translation repressor, putative  36.96 
 
 		 1185 aa  61.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  30.05 
 
 		 919 aa  61.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  42.22 
 
 		 889 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  20.83 
 
 		 780 aa  60.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  30 
 
 		 2208 aa  59.7  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1765  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.07 
 
 		 947 aa  59.3  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2605  DSH-like  29.32 
 
 		 1026 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.022552  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.78 
 
 		 747 aa  59.7  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  29.75 
 
 		 2157 aa  59.7  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  23.89 
 
 		 723 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  26.11 
 
 		 799 aa  59.3  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2129  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.48 
 
 		 988 aa  58.9  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  33.7 
 
 		 1589 aa  58.9  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  38.46 
 
 		 924 aa  58.9  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18500  superfamily II RNA helicase  28.8 
 
 		 972 aa  58.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00038205  normal  0.0935996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.77 
 
 		 762 aa  58.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.5 
 
 		 715 aa  58.2  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16000  superfamily II RNA helicase  26.7 
 
 		 961 aa  58.5  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0348006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.63 
 
 		 919 aa  58.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>