170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0111 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 364 aa  739    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  25.66 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  25.07 
 
 		 418 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  25.28 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 391 aa  89.7  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  21.57 
 
 		 792 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  24.34 
 
 		 382 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25.48 
 
 		 423 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  25.14 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  24.69 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  25.36 
 
 		 481 aa  72.8  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25.98 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  22.82 
 
 		 365 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23.49 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  21.76 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  23.82 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  24.91 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  21.58 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  25.93 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.66 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  21.79 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0496  permease YjgP/YjgQ  23.14 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  29.55 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  26.19 
 
 		 386 aa  67  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  23.82 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  22.73 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  23.08 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  22.82 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24.3 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  24.2 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  21.69 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  22.5 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  21.43 
 
 		 1061 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  22.09 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  23.42 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.44 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.28 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.18 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  23.7 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 379 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  23.88 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  23.67 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 1061 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  22.08 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  21.87 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  20.54 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  23.42 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  23.1 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  23.46 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  18.34 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  23.46 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 370 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  23.58 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  20 
 
 		 386 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  22.91 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  26.39 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  22.01 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  25.83 
 
 		 527 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  20.62 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  20.31 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  21.12 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  31.48 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  29.77 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  21.86 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  21.55 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  21.9 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0962  permease YjgP/YjgQ family protein  24.62 
 
 		 367 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 		 388 aa  53.9  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  24.4 
 
 		 400 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  23.6 
 
 		 390 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  21.92 
 
 		 358 aa  53.5  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  21.27 
 
 		 392 aa  53.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  19.71 
 
 		 358 aa  52.8  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 393 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  21.7 
 
 		 359 aa  52.8  0.000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  22.05 
 
 		 397 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  19.92 
 
 		 396 aa  52.8  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  20.19 
 
 		 356 aa  52.8  0.000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 396 aa  52.8  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  22.31 
 
 		 393 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  27.78 
 
 		 364 aa  52.8  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2683  hypothetical protein  28.1 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2555  hypothetical protein  27.27 
 
 		 359 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  23.38 
 
 		 401 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  21.15 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  26.23 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  20.59 
 
 		 651 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  28.42 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  25.89 
 
 		 366 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  23.08 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  28.42 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  22.03 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  28.42 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  20.78 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>