More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0154 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0154  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 320 aa  654    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0157  transcriptional regulator, LuxR family  58.88 
 
 		 321 aa  341  1e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1567  transcriptional regulator, LuxR family  49.84 
 
 		 323 aa  313  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0815521  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0675  transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.010777 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04540  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.57 
 
 		 320 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00820  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.75 
 
 		 320 aa  228  9e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12520  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.48 
 
 		 320 aa  207  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.816981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  44.12 
 
 		 878 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 454 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0476  transcriptional regulator, LuxR family  27.07 
 
 		 336 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.123705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  49.06 
 
 		 471 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0971  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.16732  hitchhiker  0.00115778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 216 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4503  two component LuxR family transcriptional regulator  52 
 
 		 221 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.0169691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 508 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1431  transcriptional regulator, LuxR family  37.18 
 
 		 498 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0577596  normal  0.857351 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  54 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  30.38 
 
 		 320 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3280  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 223 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0123  transcriptional regulator, LuxR family  31.87 
 
 		 492 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.891774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  39.51 
 
 		 217 aa  50.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  38.55 
 
 		 896 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.77 
 
 		 517 aa  50.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3443  transcriptional regulator, LuxR family  26.15 
 
 		 335 aa  50.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00126305  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3004  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 223 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  48 
 
 		 210 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.94 
 
 		 214 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 210 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 210 aa  49.7  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 210 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  48 
 
 		 210 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 210 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 210 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 210 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 210 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2264  LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 91 aa  49.3  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.537119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  37.1 
 
 		 907 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1925  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 204 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00015523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 249 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.98 
 
 		 224 aa  49.3  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.73 
 
 		 243 aa  49.3  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0267  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 241 aa  49.3  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1422  DNA-binding response regulator VraR  54.76 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.871667  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 488 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3507  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 213 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5595  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2193  transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.77 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6962  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.81 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.45 
 
 		 469 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  35.48 
 
 		 907 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0606  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 506 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1291  transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.979242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  49.02 
 
 		 213 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  50 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 907 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23080  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.46 
 
 		 545 aa  48.9  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.865531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0348  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 975 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0210125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0293  transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 100 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0499337  normal  0.0433315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 224 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3176  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0570221  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3909  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 211 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10690  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  23.53 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1379  two component transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0210202  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3983  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.714996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05591  DNA-binding response regulator  53.49 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.843109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3924  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19700  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.83 
 
 		 209 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0976  transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 501 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.018057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0338  transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 213 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  36.26 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  50 
 
 		 242 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0327  transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  36.26 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1067  transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.506731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 215 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2758  transcriptional regulator, LuxR family  37.66 
 
 		 523 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2565  response regulator protein  48.89 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140338  decreased coverage  0.00000000000000164026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 223 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0316  LuxR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  36.26 
 
 		 215 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2913  transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 356 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000129888  hitchhiker  0.0000689146 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 230 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  36.26 
 
 		 215 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6032  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 218 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  36.26 
 
 		 215 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0956  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 344 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.886587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  50 
 
 		 209 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  50 
 
 		 209 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>