217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_1005 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_1005  putative competence protein ComL  100 
 
 
250 aa  510  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.372557  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0812  hypothetical protein  88.26 
 
 
254 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.391537  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0485  competence lipoprotein ComL, putative  43.24 
 
 
235 aa  181  7e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0398845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1288  putative lipoprotein  33.86 
 
 
325 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.571416  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1060  putative lipoprotein  35.43 
 
 
298 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.648337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2006  putative lipoprotein  35.71 
 
 
301 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.47311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6164  hypothetical protein  36.32 
 
 
297 aa  158  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0345463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4038  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35.95 
 
 
302 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.890375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3296  putative lipoprotein  33.86 
 
 
289 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3384  putative lipoprotein  34.87 
 
 
301 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321347  normal  0.0271451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0699  DNA uptake lipoprotein-like protein  33.33 
 
 
391 aa  156  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal  0.493581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6695  putative lipoprotein  36.11 
 
 
298 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7434  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  33.2 
 
 
299 aa  155  7e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0308132  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3496  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  36.04 
 
 
288 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.24524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3135  putative lipoprotein  34.05 
 
 
291 aa  152  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0941  competence lipoprotein ComL, putative  33.33 
 
 
292 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00347404  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  35.04 
 
 
293 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  36.41 
 
 
287 aa  148  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  36.41 
 
 
287 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2068  DNA uptake lipoprotein-like protein  30.8 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.484771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1732  DNA uptake lipoprotein  33.81 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3178  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.33 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.121746  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2951  putative lipoprotein  32.33 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0171054 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0330  putative lipoprotein  35.38 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.654849  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1457  DNA uptake lipoprotein-like protein  32.38 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1999  putative lipoprotein  33.01 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2430  DNA uptake lipoprotein  34.74 
 
 
291 aa  144  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233746  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0545  DNA uptake lipoprotein  32.62 
 
 
264 aa  141  9e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.686095  normal  0.234082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  33.64 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.05 
 
 
306 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  29.91 
 
 
289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4485  putative ComL lipoprotein  35.59 
 
 
280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.159296  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2117  putative ComL lipoprotein  32.69 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.329697  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  32.52 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0792  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 
278 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.559205 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0702  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 
278 aa  132  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2414  hypothetical protein  29.27 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00110974  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2748  competence lipoprotein ComL, putative  37.5 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321012  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  32.24 
 
 
281 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  31.78 
 
 
281 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0691  competence lipoprotein ComL, putative  33.85 
 
 
283 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0174924  decreased coverage  0.000229911 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0308  DNA uptake lipoprotein-like protein  31.22 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0939  putative lipoprotein  28.86 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000292925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3162  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.57 
 
 
319 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0755  DNA uptake lipoprotein-like protein  30 
 
 
315 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0772  lipoprotein, ComL family  30.46 
 
 
272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1193  competence lipoprotein ComL  30.46 
 
 
255 aa  112  5e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1001  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.27 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.742484  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2851  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  29.15 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.06 
 
 
285 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525454  decreased coverage  0.00850682 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02485  predicted lipoprotein  26.73 
 
 
245 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.232187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1077  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.73 
 
 
245 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0504949  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2881  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0417969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1086  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.403898  decreased coverage  0.000000281733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3836  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000106829  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2976  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0410955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02449  hypothetical protein  26.73 
 
 
245 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.235598  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2749  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000166686  normal  0.272944 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2753  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000042018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3075  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.73 
 
 
245 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298644  normal  0.0263733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3352  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.82 
 
 
243 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.527935  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3478  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.82 
 
 
243 aa  105  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.531576  normal  0.377875 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3215  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.82 
 
 
243 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00228309  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1627  hypothetical protein  27.06 
 
 
289 aa  105  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2880  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2992  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2878  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.732021 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2775  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.73 
 
 
245 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000251049  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2859  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.27 
 
 
245 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1920  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.61 
 
 
258 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.177047  normal  0.0296003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0496  competence lipoprotein ComL, putative  31.25 
 
 
268 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.4475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1188  hypothetical protein  29.57 
 
 
257 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1194  hypothetical protein  29.57 
 
 
257 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2551  putative lipoprotein  28.99 
 
 
254 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00873964  normal  0.0420812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1343  transmembrane protein  26.46 
 
 
271 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1975  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 
266 aa  101  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0883  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  28.57 
 
 
243 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.192303  normal  0.0728426 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1352  hypothetical protein  26.91 
 
 
278 aa  99.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.017502  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01439  Competence lipoprotein ComL  27.23 
 
 
254 aa  99  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1334  putative lipoprotein  28.31 
 
 
255 aa  98.6  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2035  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.81 
 
 
273 aa  97.8  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.349753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3241  putative transmembrane protein  28.57 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.906255  normal  0.945315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1899  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  29.56 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1829  putative transmembrane protein  29.56 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0739498  normal  0.248165 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0716  transmembrane protein  26.24 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000618184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2236  putative lipoprotein  24.34 
 
 
253 aa  96.3  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1135  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  27.14 
 
 
244 aa  95.5  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1613  putative competence lipoprotein precursor  25.23 
 
 
267 aa  95.1  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000947749 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0592  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  25.71 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155827  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0430  competence lipoprotein ComL, putative  25.71 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.761714  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2864  putative lipoprotein  22.78 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000160081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2951  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  28.7 
 
 
248 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0644109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3014  putative lipoprotein  25.23 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.6887  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3167  putative lipoprotein  26.43 
 
 
268 aa  92.8  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0598273  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0666  putative lipoprotein  23.45 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0923  putative competence protein ComL  32.39 
 
 
219 aa  92.4  7e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2643  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 
246 aa  92.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3144  outer membrane protein assembly complex subunit YfiO  26.63 
 
 
244 aa  92  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2951  putative lipoprotein  29.17 
 
 
252 aa  92  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000165501  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0501  putative lipoprotein  25.58 
 
 
254 aa  91.7  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>