More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_01234 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01234  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2388  tryptophan synthase, alpha subunit  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.555037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01244  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1369  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.787892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2367  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 268 aa  542  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.189882  hitchhiker  0.000000219332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1459  tryptophan synthase subunit alpha  99.25 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00021114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1485  tryptophan synthase subunit alpha  99.63 
 
 		 268 aa  540  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1892  tryptophan synthase subunit alpha  98.88 
 
 		 268 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584343 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1872  tryptophan synthase subunit alpha  98.13 
 
 		 268 aa  533  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000234299 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1419  tryptophan synthase subunit alpha  85.45 
 
 		 268 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1917  tryptophan synthase subunit alpha  85.45 
 
 		 268 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000303203 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1601  tryptophan synthase subunit alpha  85.45 
 
 		 268 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0807887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1854  tryptophan synthase subunit alpha  85.45 
 
 		 268 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.230554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1859  tryptophan synthase subunit alpha  85.07 
 
 		 268 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2002  tryptophan synthase subunit alpha  79.85 
 
 		 268 aa  442  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2208  tryptophan synthase subunit alpha  82.02 
 
 		 269 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.247562  normal  0.0105692 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2301  tryptophan synthase subunit alpha  79.85 
 
 		 268 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2177  tryptophan synthase, alpha subunit  77.24 
 
 		 269 aa  428  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2672  tryptophan synthase, alpha subunit  77.24 
 
 		 268 aa  428  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000213592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1937  tryptophan synthase, alpha subunit  76.32 
 
 		 269 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1937  tryptophan synthase subunit alpha  79.48 
 
 		 268 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.66163  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2047  tryptophan synthase subunit alpha  79.1 
 
 		 268 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2317  tryptophan synthase subunit alpha  78.6 
 
 		 271 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1585  tryptophan synthase subunit alpha  66.42 
 
 		 269 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003083  tryptophan synthase alpha chain  61.42 
 
 		 268 aa  343  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.148069  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1055  tryptophan synthase, alpha subunit  60.38 
 
 		 270 aa  341  7e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2256  tryptophan synthase subunit alpha  64.39 
 
 		 267 aa  340  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.077665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3024  tryptophan synthase subunit alpha  67.05 
 
 		 278 aa  338  5e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02763  tryptophan synthase subunit alpha  60.3 
 
 		 268 aa  338  5.9999999999999996e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2408  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 278 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2706  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 273 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2727  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 273 aa  333  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.126376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1457  tryptophan synthase subunit alpha  65.53 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2806  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2917  tryptophan synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 272 aa  332  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.410631  normal  0.883222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1515  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 278 aa  331  8e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.157433  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1523  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 278 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107227 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1659  tryptophan synthase subunit alpha  65.15 
 
 		 278 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681458  hitchhiker  0.0000116704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3527  tryptophan synthase, alpha subunit  59.41 
 
 		 282 aa  328  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1149  tryptophan synthase subunit alpha  62.17 
 
 		 268 aa  328  4e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0791  tryptophan synthase subunit alpha  62.92 
 
 		 268 aa  328  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000662896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1681  tryptophan synthase subunit alpha  64.02 
 
 		 272 aa  328  6e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2455  tryptophan synthase subunit alpha  63.64 
 
 		 281 aa  326  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1424  tryptophan synthase subunit alpha  63.64 
 
 		 267 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2134  tryptophan synthase subunit alpha  63.91 
 
 		 266 aa  315  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.713088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02293  tryptophan synthase subunit alpha  55.38 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2834  tryptophan synthase, alpha subunit  54.89 
 
 		 280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0222  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0214  tryptophan synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1393  tryptophan synthase subunit alpha  42.34 
 
 		 274 aa  192  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000108372  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  41.98 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0077  tryptophan synthase subunit alpha  39.04 
 
 		 270 aa  188  7e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1791  tryptophan synthase, alpha subunit  38.02 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0109  tryptophan synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 259 aa  182  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.472512  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0008  tryptophan synthase subunit alpha  41.88 
 
 		 271 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.362998  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0572  tryptophan synthase subunit alpha  39.83 
 
 		 280 aa  182  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.217284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 263 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06271  tryptophan synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06281  tryptophan synthase subunit alpha  39 
 
 		 275 aa  178  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05981  tryptophan synthase subunit alpha  39 
 
 		 280 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  36.74 
 
 		 265 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2477  tryptophan synthase subunit alpha  39.25 
 
 		 269 aa  175  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.854745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  40.17 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1563  tryptophan synthase subunit alpha  40.07 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  39.85 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0911  tryptophan synthase, alpha subunit  38.33 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000294001  hitchhiker  0.0000000028477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  37.7 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06371  tryptophan synthase subunit alpha  37.6 
 
 		 279 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0916  tryptophan synthase subunit alpha  34.69 
 
 		 268 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2727  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.186329  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  35.85 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1411  tryptophan synthase, alpha chain  38.43 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0564396  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  36.4 
 
 		 302 aa  168  7e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0159  tryptophan synthase, alpha subunit  39.08 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 269 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0142  tryptophan synthase, alpha subunit  37.35 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18161  tryptophan synthase subunit alpha  39.32 
 
 		 278 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0751628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  40.33 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  37.36 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05751  tryptophan synthase subunit alpha  39.24 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  38.06 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1301  tryptophan synthase subunit alpha  38.93 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.699121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  36.5 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0096  tryptophan synthase subunit alpha  37.14 
 
 		 278 aa  165  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0773  tryptophan synthase subunit alpha  32.84 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0621096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  39.51 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  38.31 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0192  tryptophan synthase, alpha subunit  36.07 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  37.22 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  36.3 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  36.23 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  35.06 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0896  tryptophan synthase subunit alpha  40.52 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  34.57 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  34.57 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  33.46 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0634  tryptophan synthase subunit alpha  35.08 
 
 		 278 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.12721 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0812  tryptophan synthase subunit alpha  36.6 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>