62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1847 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1847  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 313 aa  630  1e-180  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3250  polysaccharide deacetylase family protein  40.73 
 
 		 317 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1500  polysaccharide deacetylase family protein  32.06 
 
 		 304 aa  182  6e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.89834  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1265  polysaccharide deacetylase  28.34 
 
 		 324 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.493777  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  31.41 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  30.52 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0677  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0110  polysaccharide deacetylase  30.05 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2761  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 		 398 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0205212  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2853  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 398 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2945  polysaccharide deacetylase  29.67 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1065  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.012185  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1967  polysaccharide deacetylase  28.72 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.09 
 
 		 672 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2541  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0393046  normal  0.0973746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1729  polysaccharide deacetylase  28.9 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0507  polysaccharide deacetylase  31.13 
 
 		 352 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3306  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.582105 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3074  polysaccharide deacetylase  22.26 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2642  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 397 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.149181  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2728  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 		 400 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 		 598 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2465  polysaccharide deacetylase  24.46 
 
 		 348 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2823  polysaccharide deacetylase  27.59 
 
 		 400 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.42622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1452  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 		 291 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  40.32 
 
 		 590 aa  49.7  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2028  polysaccharide deacetylase  22.35 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.30621  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0140  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 		 347 aa  48.5  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5370  polysaccharide deacetylase  30.69 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1958  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.7 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.15292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0880  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4585  polysaccharide deacetylase  33.08 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.701791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 282 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1081  polysaccharide deacetylase  29.9 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00669059  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2459  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 318 aa  46.2  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0185568  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  19.37 
 
 		 327 aa  45.8  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  25.49 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  25.49 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0405  polysaccharide deacetylase  39.73 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0189593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0229  polysaccharide deacetylase family protein  39.73 
 
 		 238 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00859248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5301  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2013  polysaccharide deacetylase  24.47 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0187  hypothetical protein  25.3 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0414  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5046  polysaccharide deacetylase  32.33 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.447167  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5271  polysaccharide deacetylase  28.85 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  25.56 
 
 		 224 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4676  polysaccharide deacetylase  28.09 
 
 		 322 aa  43.5  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal  0.272149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4358  polysaccharide deacetylase  33.75 
 
 		 265 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5826  polysaccharide deacetylase  23.12 
 
 		 354 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0739761  normal  0.758977 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3052  polysaccharide deacetylase  31.4 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  36.07 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  36.07 
 
 		 239 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  33 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3076  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 		 258 aa  43.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  34.29 
 
 		 270 aa  42.7  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1640  polysaccharide deacetylase  23.95 
 
 		 337 aa  42.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2609  polysaccharide deacetylase  29.29 
 
 		 408 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.644601  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>