More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1926 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1926  beta-lactamase  100 
 
 
387 aa  798    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.449475  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2343  beta-lactamase  57.79 
 
 
309 aa  339  4e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2842  hypothetical protein  28.75 
 
 
315 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.653108  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3056  hypothetical protein  28.75 
 
 
315 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0766054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2815  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.43 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.22186  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3068  hypothetical protein  28.12 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2835  beta-lactamase  28.8 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00277998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3052  beta-lactamase  27.8 
 
 
313 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2775  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.62 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.522634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3085  hypothetical protein  27.48 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1900  beta-lactamase  29.76 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3087  hypothetical protein  27.48 
 
 
315 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1202  beta-lactamase class C and other pencillin-binding proteins  28.71 
 
 
340 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2784  hypothetical protein  29.9 
 
 
305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2758  hypothetical protein  29.9 
 
 
305 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000446923 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2564  hypothetical protein  29.9 
 
 
309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00591943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2750  hypothetical protein  29.9 
 
 
309 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6049  putative Beta-lactamase  29.84 
 
 
524 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0282  beta-lactamase  30.69 
 
 
363 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2520  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.57 
 
 
305 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.155828  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0953  beta-lactamase  26.15 
 
 
323 aa  125  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.062274  normal  0.647225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2408  putative Beta-lactamase  24.85 
 
 
366 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.967786  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2194  beta-lactamase  26.2 
 
 
314 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2529  beta-lactamase  28.57 
 
 
305 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00060591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2805  beta-lactamase  29.9 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.588828  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5602  beta-lactamase  28.8 
 
 
475 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.887864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2556  beta-lactamase  29.33 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2485  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  29.24 
 
 
305 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0277031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2763  beta-lactamase  28.57 
 
 
305 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2342  ABC transporter related  73.97 
 
 
783 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5746  beta-lactamase  24.36 
 
 
328 aa  116  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0186796  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3232  beta-lactamase  28.88 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1472  beta-lactamase  27.39 
 
 
395 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.210469  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1013  beta-lactamase  29.47 
 
 
598 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.373365  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0905  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.84 
 
 
425 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0215  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  27.46 
 
 
419 aa  109  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5729  beta-lactamase  27.3 
 
 
389 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6417  beta-lactamase  26.52 
 
 
396 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131467  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2638  beta-lactamase  28.98 
 
 
387 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3124  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.33 
 
 
415 aa  104  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1082  beta-lactamase  27.37 
 
 
384 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00482001  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6344  hypothetical protein  29.93 
 
 
414 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4917  hypothetical protein  25.99 
 
 
371 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.870689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3665  beta-lactamase  22.9 
 
 
374 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0974173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4078  beta-lactamase  25.48 
 
 
380 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119534  normal  0.98336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3965  beta-lactamase  25.48 
 
 
380 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56530  hypothetical protein  25.24 
 
 
384 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1128  beta-lactamase  25.43 
 
 
337 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.170129  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2177  beta-lactamase  26.52 
 
 
417 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24822  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0919  beta-lactamase  26.62 
 
 
405 aa  99.8  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.357433  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73090  hypothetical protein  29.78 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.129935  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2259  beta-lactamase  23.19 
 
 
337 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.777809  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0047  Beta-lactamase  23.17 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.705226  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03585  hypothetical protein  28.09 
 
 
383 aa  96.7  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45249  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0474  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  28.93 
 
 
449 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5884  beta-lactamase  27.21 
 
 
412 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0635  beta-lactamase  23.68 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37730  beta-lactamase class C protein  25.41 
 
 
371 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4964  beta-lactamase  25.24 
 
 
335 aa  94  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663595  normal  0.0104106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4279  beta-lactamase  24.59 
 
 
400 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1129  beta-lactamase  27.18 
 
 
372 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1083  beta-lactamase  23.32 
 
 
328 aa  92.8  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1949  beta-lactamase  25.08 
 
 
486 aa  92.8  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0992  beta-lactamase  26.48 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000425136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4213  beta-lactamase  23.64 
 
 
504 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.780595  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2731  beta-lactamase  23.45 
 
 
640 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4352  hydrolase, putative  26.32 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3388  beta-lactamase  25 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.231514 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0196  beta-lactamase  25.44 
 
 
399 aa  92  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3770  beta-lactamase  26.6 
 
 
428 aa  92  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000344014  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4462  beta-lactamase  27.42 
 
 
362 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210437  hitchhiker  0.0088578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3687  beta-lactamase  25.24 
 
 
342 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.057596  normal  0.380458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1494  Beta-lactamase  25.71 
 
 
505 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0788592  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1198  beta-lactamase  23.87 
 
 
333 aa  90.1  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.98564  normal  0.588017 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6213  beta-lactamase  24.76 
 
 
390 aa  89.7  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2025  beta-lactamase  24.91 
 
 
401 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.829209  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1811  beta-lactamase  23.86 
 
 
356 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2236  amide hydrolase  25.64 
 
 
340 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0078  excinuclease ABC subunit A  51.85 
 
 
1867 aa  87.8  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4047  Beta-lactamase  24.01 
 
 
368 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1250  Beta-lactamase  24.26 
 
 
338 aa  87.4  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0393  excinuclease ABC subunit A  53.09 
 
 
952 aa  87  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0822  beta-lactamase  22.09 
 
 
483 aa  86.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.242788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0029  beta-lactamase  25.64 
 
 
505 aa  86.3  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.667975  normal  0.0405415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4710  beta-lactamase  27.6 
 
 
396 aa  86.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0017  putative 6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.28 
 
 
468 aa  86.3  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1824  excinuclease ABC, A subunit  50 
 
 
945 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00152877  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2235  hypothetical protein  24.65 
 
 
346 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0910  beta-lactamase  24.65 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0226  hypothetical protein  70.37 
 
 
935 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.544357 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2861  beta-lactamase  23.75 
 
 
530 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1381  6-aminohexanoate-dimer hydrolase  26.44 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3862  excinuclease ABC, A subunit  72.22 
 
 
968 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.609984  normal  0.59901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1544  beta-lactamase  25 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.518663  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3698  excinuclease ABC subunit A  74.07 
 
 
944 aa  85.5  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0889  beta-lactamase  27.97 
 
 
378 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0436  excinuclease ABC subunit A  69.81 
 
 
940 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.64292  normal  0.354082 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2229  excinuclease ABC, A subunit  71.7 
 
 
944 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.748559  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  46.91 
 
 
957 aa  84  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_487  excinuclease ATPase subunit  66.67 
 
 
946 aa  83.6  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0328859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>