85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1678 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
300 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  26.5 
 
 
362 aa  133  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  30.38 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  28.43 
 
 
361 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  28.06 
 
 
320 aa  112  9e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  29.9 
 
 
306 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.51 
 
 
306 aa  86.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
307 aa  85.5  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  25.6 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.13 
 
 
315 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  25.08 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.46 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  22.87 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  21.62 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  22.84 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  23.63 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  25.84 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  21.94 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  23.24 
 
 
315 aa  63.2  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  23.31 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  24.42 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  22.61 
 
 
316 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  20.07 
 
 
313 aa  59.7  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  25.09 
 
 
295 aa  59.3  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  24.2 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  21.15 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  24.11 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  20.27 
 
 
312 aa  56.6  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  26.32 
 
 
299 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  23.59 
 
 
327 aa  53.5  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  24.91 
 
 
291 aa  53.1  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  23.59 
 
 
321 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  24.71 
 
 
325 aa  51.6  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  22.8 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  22.55 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  22.8 
 
 
349 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.56 
 
 
302 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  23.14 
 
 
311 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  23.3 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.26 
 
 
315 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  25.09 
 
 
291 aa  49.7  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  24.84 
 
 
313 aa  49.3  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  23.79 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  22.8 
 
 
330 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  19.62 
 
 
295 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  20.49 
 
 
297 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.2 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  21.38 
 
 
317 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  26.42 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  26.28 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  23.51 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  25.59 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  25.44 
 
 
315 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  20.49 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  22.85 
 
 
316 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  22.9 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  24.42 
 
 
311 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  25.1 
 
 
291 aa  46.6  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  23.08 
 
 
317 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  23.43 
 
 
311 aa  46.2  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  26.4 
 
 
302 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  23.61 
 
 
291 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  22.86 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  22.49 
 
 
314 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  21.94 
 
 
307 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  24.68 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  25.12 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  23.39 
 
 
337 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  21.1 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  21.4 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  24.42 
 
 
320 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  25.17 
 
 
311 aa  43.5  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  23.95 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  22.34 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  23.45 
 
 
320 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  22.12 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  23.45 
 
 
320 aa  42.7  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  22.85 
 
 
320 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  23.29 
 
 
313 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 
319 aa  42.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  22.81 
 
 
313 aa  42.4  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  21.36 
 
 
330 aa  42.4  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  21.26 
 
 
318 aa  42.4  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  21.45 
 
 
304 aa  42.4  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>