More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4197 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  31.82 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  31.82 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2399  hypothetical protein  30.88 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  32.04 
 
 		 330 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  34.4 
 
 		 314 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  30.28 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  31.32 
 
 		 330 aa  149  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3288  hypothetical protein  32.25 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0157396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0434  hypothetical protein  32.65 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000234827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3047  hypothetical protein  33.81 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  31.74 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  29.9 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1696  hypothetical protein  32.14 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  32.86 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0498  hypothetical protein  28.62 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2476  hypothetical protein  31.9 
 
 		 321 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0303847  normal  0.0316178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  31.88 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  30.57 
 
 		 331 aa  139  7e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6283  hypothetical protein  29.32 
 
 		 321 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120039  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  28.57 
 
 		 322 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6277  hypothetical protein  33.46 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  32.34 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  31.03 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  30.46 
 
 		 328 aa  136  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3493  hypothetical protein  34.07 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  30.23 
 
 		 351 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  29.39 
 
 		 321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  32.67 
 
 		 324 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  32.96 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  33.1 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  29.26 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1911  hypothetical protein  29.11 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248685  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3088  hypothetical protein  33.23 
 
 		 322 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  30.31 
 
 		 322 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  30.6 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4597  hypothetical protein  33.08 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  36.78 
 
 		 339 aa  132  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  31.7 
 
 		 333 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4457  hypothetical protein  31.6 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0502897  normal  0.32716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03750  extra-cytoplasmic solute receptor, Bug family  30.82 
 
 		 334 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.549978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  31.25 
 
 		 339 aa  132  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1674  hypothetical protein  31.82 
 
 		 326 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  30.53 
 
 		 333 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2926  hypothetical protein  27.86 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0056  hypothetical protein  32.64 
 
 		 328 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1904  hypothetical protein  32.53 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  33.9 
 
 		 335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  28.98 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  29.69 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  30.42 
 
 		 331 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  31.34 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  32.71 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4068  hypothetical protein  34.14 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  30.77 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  31.95 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  32.12 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  30.52 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  30.27 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  32.06 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0073  hypothetical protein  32.78 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485967  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  31.99 
 
 		 341 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  32.18 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  31.34 
 
 		 321 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1395  hypothetical protein  30.54 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.107231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4275  extra-cytoplasmic solute receptor  29.05 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0444565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4137  hypothetical protein  32.06 
 
 		 326 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.864349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  31.42 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1021  hypothetical protein  32.41 
 
 		 323 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.345353  normal  0.559311 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  28.48 
 
 		 327 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  30.03 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3597  hypothetical protein  31.68 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2783  hypothetical protein  31.97 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1719  hypothetical protein  31.46 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  29.64 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  28.9 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  28.53 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  29.75 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  28.8 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  27.65 
 
 		 335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3575  hypothetical protein  30.03 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0094  hypothetical protein  28.87 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  29.79 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  28.9 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  30.29 
 
 		 336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  28.47 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  33.46 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  28.28 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  27.17 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  28.62 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  28.37 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  29.26 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  30.71 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  28.33 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  32.12 
 
 		 330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  29.78 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  28.66 
 
 		 322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  32.95 
 
 		 330 aa  126  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4557  hypothetical protein  31.25 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>