More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_03750 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_03750  extra-cytoplasmic solute receptor, Bug family  100 
 
 
334 aa  662    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.549978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  37.14 
 
 
326 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  37.41 
 
 
337 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  38.78 
 
 
332 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5492  hypothetical protein  38.44 
 
 
329 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  35.56 
 
 
325 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  40.06 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3265  hypothetical protein  36.84 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  36.94 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  36.99 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  38.73 
 
 
322 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  37.81 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4626  hypothetical protein  37.72 
 
 
318 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539192  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  36.68 
 
 
328 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6310  hypothetical protein  38.74 
 
 
325 aa  182  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.238348  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  36.84 
 
 
339 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  39.16 
 
 
332 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  37.05 
 
 
318 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  37.5 
 
 
328 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.25 
 
 
318 aa  179  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  36.82 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  30.98 
 
 
322 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1686  hypothetical protein  43.09 
 
 
331 aa  178  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  38.19 
 
 
334 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  34.19 
 
 
325 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  35.83 
 
 
328 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5503  extra-cytoplasmic solute receptor  39.69 
 
 
322 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  36.97 
 
 
343 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1680  hypothetical protein  36.31 
 
 
330 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.140341  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5303  hypothetical protein  38.75 
 
 
325 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0123034  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  35.8 
 
 
332 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3420  hypothetical protein  36.09 
 
 
333 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  35.99 
 
 
326 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  37 
 
 
347 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  38.06 
 
 
320 aa  175  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.93 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  36.91 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3609  hypothetical protein  35.71 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.600337  normal  0.0172311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21240  hypothetical protein  37.95 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00058939  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1866  hypothetical protein  38.74 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  30.58 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  36.67 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4970  hypothetical protein  36.51 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  35.93 
 
 
324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3024  hypothetical protein  35.69 
 
 
332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  39.1 
 
 
326 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  38.79 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  36.1 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.68 
 
 
325 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  38.13 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  37.78 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.92 
 
 
327 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0284  hypothetical protein  35.49 
 
 
323 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  35.71 
 
 
317 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  36.09 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  33.54 
 
 
328 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  36.27 
 
 
330 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  36.6 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  37.07 
 
 
361 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  35.78 
 
 
331 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  33.54 
 
 
328 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  34.7 
 
 
328 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  34.85 
 
 
330 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2463  hypothetical protein  35.99 
 
 
327 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5830  hypothetical protein  38.73 
 
 
339 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  34.65 
 
 
345 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  34.81 
 
 
325 aa  171  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  33.85 
 
 
330 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  34.65 
 
 
330 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  40.59 
 
 
337 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  35.35 
 
 
334 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  34.47 
 
 
325 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  36.14 
 
 
326 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  35.4 
 
 
329 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  35.14 
 
 
314 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0801  hypothetical protein  37 
 
 
337 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  36.99 
 
 
331 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  35.64 
 
 
333 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  36.71 
 
 
330 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2597  hypothetical protein  39.29 
 
 
331 aa  170  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0909173  normal  0.221055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  37.5 
 
 
330 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  37.89 
 
 
332 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  35.4 
 
 
329 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  36.56 
 
 
327 aa  170  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  36.71 
 
 
330 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1098  hypothetical protein  38.62 
 
 
339 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  35.03 
 
 
336 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4308  hypothetical protein  35.66 
 
 
343 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.41466 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  36.39 
 
 
327 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  35.65 
 
 
329 aa  169  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2777  hypothetical protein  37.02 
 
 
322 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.89737  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  34.58 
 
 
337 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  35.45 
 
 
342 aa  169  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  35.67 
 
 
327 aa  168  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1722  hypothetical protein  38.62 
 
 
338 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  35.15 
 
 
327 aa  169  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  36.68 
 
 
339 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  34.67 
 
 
331 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  32.78 
 
 
333 aa  168  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  34.38 
 
 
333 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>