More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6310 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6310  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  650    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.238348  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0836  hypothetical protein  39.19 
 
 		 340 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  39.88 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1399  hypothetical protein  36.59 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  36.14 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  39.44 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  41.23 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  39.81 
 
 		 328 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4309  hypothetical protein  38.54 
 
 		 336 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  42.4 
 
 		 325 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  40.79 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.74 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0476  hypothetical protein  38.06 
 
 		 330 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.211749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0467  hypothetical protein  38.06 
 
 		 345 aa  198  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  35.63 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3703  hypothetical protein  38.26 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  35.42 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  37.89 
 
 		 331 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  35.26 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.8 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  34.19 
 
 		 341 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6179  hypothetical protein  36.12 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  38.56 
 
 		 330 aa  195  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3917  extra-cytoplasmic solute receptor  36.42 
 
 		 328 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03750  extra-cytoplasmic solute receptor, Bug family  39.63 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.549978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  38.49 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1376  hypothetical protein  37.54 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.537354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  38.12 
 
 		 321 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.14 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  40.13 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  40.13 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  38.6 
 
 		 331 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4163  hypothetical protein  34.47 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0521612  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  34.97 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.7 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  35.76 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  37.58 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4408  extra-cytoplasmic solute receptor  32.89 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0323746  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  38.23 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  39.5 
 
 		 336 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5494  extra-cytoplasmic solute receptor  35.6 
 
 		 329 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  35.93 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  36.76 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6345  hypothetical protein  37.58 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.38 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  39.16 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  36.9 
 
 		 330 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  35.92 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  37 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  35.65 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  36.81 
 
 		 325 aa  185  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4203  extra-cytoplasmic solute receptor  37.21 
 
 		 335 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.712641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3854  hypothetical protein  35.56 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  39.73 
 
 		 314 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  37.77 
 
 		 330 aa  185  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  32.72 
 
 		 325 aa  185  9e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  34.49 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  34.65 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  35.03 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  37.37 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6079  hypothetical protein  34.56 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5058  extra-cytoplasmic solute receptor  39.48 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0827045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4494  hypothetical protein  37.88 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.19 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  36.18 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  35.27 
 
 		 334 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3347  hypothetical protein  37.17 
 
 		 330 aa  184  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  37.26 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.13 
 
 		 328 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  38.49 
 
 		 334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1686  hypothetical protein  36.3 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.893749  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  35.25 
 
 		 337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  38.13 
 
 		 330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  35.43 
 
 		 337 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  34.46 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  38.16 
 
 		 339 aa  182  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  36.93 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  36.93 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5038  extra-cytoplasmic solute receptor  37.29 
 
 		 348 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1733  hypothetical protein  32.91 
 
 		 330 aa  182  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.26 
 
 		 345 aa  182  7e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  37.74 
 
 		 336 aa  182  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.26 
 
 		 345 aa  182  7e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1930  hypothetical protein  32.91 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.886467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  39.35 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  38.73 
 
 		 326 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  39.44 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  35.69 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  39.94 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3894  hypothetical protein  37.37 
 
 		 327 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  35.78 
 
 		 328 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  35.45 
 
 		 336 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3088  putative signal peptide protein  37.15 
 
 		 317 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0784453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  33.85 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  34.75 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  37.77 
 
 		 356 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4615  hypothetical protein  37.98 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.19 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>