More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2078 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2078  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  696    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000784829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1971  hypothetical protein  35.5 
 
 
336 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.803745  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1220  hypothetical protein  33 
 
 
328 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.216947  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4211  periplasmic binding protein  32.21 
 
 
324 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352553 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03721  conserved hypothetical protein  32.21 
 
 
324 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03670  hypothetical protein  32.21 
 
 
324 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3545  hypothetical protein  32.79 
 
 
350 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2795  hypothetical protein  30.23 
 
 
341 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.687935  normal  0.0471733 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5327  hypothetical protein  32 
 
 
322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0336  hypothetical protein  29.79 
 
 
330 aa  151  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  32.15 
 
 
338 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2229  hypothetical protein  32.26 
 
 
349 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4493  hypothetical protein  31.39 
 
 
341 aa  150  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1853  hypothetical protein  28.61 
 
 
337 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  30.1 
 
 
347 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3428  hypothetical protein  29.68 
 
 
337 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.10884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3051  hypothetical protein  29.87 
 
 
345 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal  0.28827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5629  periplasmic tricarboxylate binding receptor (TctC)  29.45 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2026  hypothetical protein  29.28 
 
 
337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0845932  normal  0.461256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5726  hypothetical protein  30.16 
 
 
328 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00555624  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2792  hypothetical protein  30.49 
 
 
346 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3513  hypothetical protein  31.79 
 
 
333 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  32.34 
 
 
342 aa  136  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3931  hypothetical protein  35.27 
 
 
320 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1719  hypothetical protein  30.1 
 
 
326 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0711752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0482  hypothetical protein  29.17 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4416  hypothetical protein  30.52 
 
 
327 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  31.19 
 
 
333 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4197  hypothetical protein  32.06 
 
 
316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504073  normal  0.975042 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4433  hypothetical protein  31 
 
 
325 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0241  twin-arginine translocation pathway signal  33.73 
 
 
332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.862974  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4224  hypothetical protein  30.39 
 
 
328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190974  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1252  hypothetical protein  30.39 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.336107  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2869  hypothetical protein  34.2 
 
 
329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7081  hypothetical protein  33.72 
 
 
319 aa  127  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3088  hypothetical protein  32.52 
 
 
322 aa  127  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0734  hypothetical protein  31.19 
 
 
322 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0775704  decreased coverage  0.00137039 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  30.56 
 
 
330 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3084  hypothetical protein  32.18 
 
 
326 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.482393  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2356  hypothetical protein  33.83 
 
 
329 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.632454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  28.88 
 
 
326 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3516  hypothetical protein  28.52 
 
 
318 aa  123  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000184229  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0726  hypothetical protein  31.18 
 
 
329 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3098  hypothetical protein  31.6 
 
 
329 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.49783  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3490  hypothetical protein  31.54 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.970248  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2047  tricarboxylic transporter, periplasmic ligand binding protein, TctC  27.16 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334258  normal  0.421066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1453  hypothetical protein  29.85 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.321026  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0298  hypothetical protein  29.69 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1161  hypothetical protein  31.82 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000162598  normal  0.390366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3134  hypothetical protein  30.23 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0701575  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5896  hypothetical protein  30.35 
 
 
332 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971815  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1420  TRAP-T family transporter periplasmic binding protein  31.54 
 
 
314 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1799  hypothetical protein  27.83 
 
 
330 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.841157  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0623  hypothetical protein  28.37 
 
 
339 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1636  TctC protein  31.06 
 
 
321 aa  119  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.777278  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0950  hypothetical protein  28.29 
 
 
323 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  29.84 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2701  hypothetical protein  29.93 
 
 
420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2083  hypothetical protein  32.4 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280461  normal  0.301608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  29.48 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  30.03 
 
 
326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2501  hypothetical protein  28.31 
 
 
338 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4766  hypothetical protein  30.59 
 
 
326 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0842  hypothetical protein  28.71 
 
 
331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610001  normal  0.942349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54540  hypothetical protein  31.42 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000174239  normal  0.0908275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  27.51 
 
 
327 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3440  hypothetical protein  28.96 
 
 
324 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000394825  normal  0.952417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  28.24 
 
 
336 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1420  twin-arginine translocation pathway signal  28.86 
 
 
327 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00102429  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2224  hypothetical protein  27.04 
 
 
332 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198093  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4257  hypothetical protein  31.08 
 
 
314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2824  hypothetical protein  31.68 
 
 
321 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0750754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0291  hypothetical protein  33.2 
 
 
333 aa  115  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0982  hypothetical protein  25.41 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3300  hypothetical protein  33.09 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.659933  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  28.4 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1353  hypothetical protein  29.04 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0759073  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  28.52 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  29.39 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  29.96 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  28.9 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4691  hypothetical protein  27.67 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  28.43 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3336  hypothetical protein  29.87 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2849  hypothetical protein  28.9 
 
 
340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225811  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  29.04 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3636  hypothetical protein  29.87 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3799  hypothetical protein  27.3 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  28.52 
 
 
322 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1024  hypothetical protein  28.43 
 
 
326 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633996  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1842  twin-arginine translocation pathway signal  28.66 
 
 
327 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00400007  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1958  hypothetical protein  27.81 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.654771  normal  0.486973 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  27.42 
 
 
327 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  27.1 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1058  hypothetical protein  28.38 
 
 
326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5887  hypothetical protein  29.52 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.947907  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1363  hypothetical protein  29.9 
 
 
325 aa  113  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  30.6 
 
 
322 aa  113  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  27.71 
 
 
328 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  28.62 
 
 
327 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>