More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0895 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0895  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 621 aa  1201    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.693546  normal  0.575051 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4050  hypothetical protein  51.25 
 
 		 629 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35522  normal  0.114627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.89 
 
 		 578 aa  196  7e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3157  hypothetical protein  39.9 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.842057  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1311  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.5 
 
 		 386 aa  118  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000182  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2398  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.81 
 
 		 531 aa  86.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2284  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.45 
 
 		 514 aa  84.3  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3130  putative serine protease  32.47 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0656366  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.05 
 
 		 368 aa  66.6  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3867  forkhead-associated protein  32.81 
 
 		 404 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3423  protein kinase  33.67 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  32.39 
 
 		 525 aa  63.9  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.24 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  32.93 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  29.83 
 
 		 490 aa  60.8  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  29.17 
 
 		 468 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0403  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.9 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000492986  n/a   
 
 
 
NC_013205  Aaci_2439  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.75 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829047  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3396  trypsin-like serine protease  28.71 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  33.53 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  34.15 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.69 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  29.28 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.74 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  34.15 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  28.73 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  35.16 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  29.28 
 
 		 514 aa  58.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  28.73 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  35.54 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  27.93 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  32.62 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  32.97 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  30.51 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  21.77 
 
 		 845 aa  57.4  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  30.54 
 
 		 374 aa  56.6  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  32.79 
 
 		 382 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.57 
 
 		 364 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  26.82 
 
 		 494 aa  56.6  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  27.93 
 
 		 503 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  31.22 
 
 		 413 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  26.37 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  32.93 
 
 		 347 aa  55.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  26.37 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 375 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  26.37 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  26.37 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.79 
 
 		 481 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  33.33 
 
 		 473 aa  55.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.92 
 
 		 379 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  26.37 
 
 		 495 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  33.73 
 
 		 527 aa  55.5  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  26.37 
 
 		 495 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  29.28 
 
 		 464 aa  55.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.79 
 
 		 484 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  26.37 
 
 		 495 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  26.37 
 
 		 495 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  29.59 
 
 		 323 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  30.54 
 
 		 855 aa  55.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.12 
 
 		 426 aa  55.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  29.47 
 
 		 264 aa  55.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  26.82 
 
 		 493 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  33.73 
 
 		 384 aa  54.7  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  31.56 
 
 		 374 aa  54.7  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  29.89 
 
 		 511 aa  54.7  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  26.82 
 
 		 493 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  26.82 
 
 		 493 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  31.98 
 
 		 524 aa  54.7  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0103  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.79 
 
 		 367 aa  54.3  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  29.28 
 
 		 482 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.48 
 
 		 362 aa  53.9  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  29.23 
 
 		 368 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  30.22 
 
 		 496 aa  53.9  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  31.72 
 
 		 477 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  26.26 
 
 		 494 aa  53.9  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  31.72 
 
 		 477 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  28.19 
 
 		 369 aa  53.9  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  31.72 
 
 		 479 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  26.82 
 
 		 494 aa  53.9  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  26.82 
 
 		 494 aa  53.9  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  31.72 
 
 		 492 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  31.41 
 
 		 382 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  31.67 
 
 		 341 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  30.77 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.72 
 
 		 439 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  30.77 
 
 		 483 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  32.54 
 
 		 528 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  29.22 
 
 		 526 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.24 
 
 		 483 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  28.65 
 
 		 511 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  23.84 
 
 		 389 aa  53.5  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  30.17 
 
 		 373 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.2 
 
 		 512 aa  53.5  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  28.49 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  26.82 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  29.39 
 
 		 487 aa  52.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2049  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.65 
 
 		 275 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.718333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1716  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.38 
 
 		 280 aa  53.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.319195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>