86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1231 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1231  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 441 aa  910    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0692085  normal  0.545036 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0929  transcriptional regulator, LuxR family  40.9 
 
 		 498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.661011 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2244  transcriptional regulator, LuxR family  38.48 
 
 		 446 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0664  putative response regulator protein  41.04 
 
 		 508 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3740  LuxR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3322  transcriptional regulator, LuxR family  32.64 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.304808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0947  two component LuxR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00385235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1271 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.93 
 
 		 1172 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1277  Hpt sensor hybrid histidine kinase  24.49 
 
 		 811 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2173  LuxR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1366  probable regulatory protein, LuxR domain protein  31.51 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0038  transcriptional regulator, LuxR family  26.37 
 
 		 307 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3044  DMSO/TMAO-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 		 813 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1031  transcriptional regulator, LuxR family  32.21 
 
 		 439 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0103  sensory box histidine kinase  25 
 
 		 703 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2430  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  24.42 
 
 		 918 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4769  transcriptional regulator, LuxR family  34.78 
 
 		 284 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.141742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 230 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03706  hypothetical protein  36.76 
 
 		 214 aa  47.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002362  DNA-binding HTH domain-containing protein  36.76 
 
 		 214 aa  47  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0501055  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 217 aa  46.6  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 220 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4360  transcriptional regulator, LuxR family  32.65 
 
 		 381 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3104  LuxR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 163 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218126  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 206 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 208 aa  46.6  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0459  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 207 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3972  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 251 aa  46.6  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 216 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1633  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 226 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5034  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.47 
 
 		 935 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.314145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5446  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 218 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.26634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 254 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 246 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2523  regulatory protein, LuxR  40.74 
 
 		 879 aa  45.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 218 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 223 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0728  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 217 aa  45.8  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.18 
 
 		 213 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.11 
 
 		 225 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1062  transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 234 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  36.76 
 
 		 212 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3979  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 220 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487116  normal  0.704163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.71 
 
 		 226 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5727  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 212 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  37.93 
 
 		 229 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2258  transcriptional regulator, LuxR family  40.82 
 
 		 476 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 217 aa  44.3  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3000  two component LuxR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 263 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.42213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 219 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  34.92 
 
 		 220 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 243 aa  44.3  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2786  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 210 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0443035  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0882  LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 253 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3804  two component transcriptional regulator, LuxR family  36 
 
 		 216 aa  44.3  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.185264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2814  LuxR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 214 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 209 aa  44.3  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 208 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 224 aa  43.9  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5475  regulatory protein, LuxR  32.99 
 
 		 911 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450601  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5380  regulatory protein, LuxR  33.33 
 
 		 315 aa  43.9  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.869493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 223 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 522 aa  43.9  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 224 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  43.5  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1379  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 292 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0210202  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4664  two component LuxR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 219 aa  43.5  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 209 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1975  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 293 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0150451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1191  LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 275 aa  43.5  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 219 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0065  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 204 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  26.8 
 
 		 367 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3176  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 292 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0570221  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1127  two component regulator propeller domain protein  25.48 
 
 		 924 aa  43.1  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 208 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 229 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4527  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.25 
 
 		 223 aa  43.1  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.658241 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  34.43 
 
 		 210 aa  43.1  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3582  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 263 aa  43.1  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0875  LuxR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 254 aa  43.1  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  39.68 
 
 		 947 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  34.43 
 
 		 210 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>