97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0875 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0875  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  515  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1685  hypothetical protein  38 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.301525  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5478  LuxR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.336666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 229 aa  50.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  38.33 
 
 		 919 aa  48.9  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  32.98 
 
 		 938 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0460  transcriptional regulator, LuxR family  27.88 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.343765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5220  transcriptional regulator, LuxR family  37.8 
 
 		 960 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.98 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 220 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3390  LuxR family two component transcriptional regulator  32.56 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.269937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5387  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.62 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3423  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4314  transcriptional regulator, LuxR family  34.83 
 
 		 132 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38490  Response regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  32.88 
 
 		 977 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4027  DNA-binding response regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1384  LuxR response regulator receiver  45.61 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2814  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 146 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0940527 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.38 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2417  LuxR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2898  LuxR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 166 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4024  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000136895 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1635  LuxR family two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2008  hypothetical protein  24.09 
 
 		 412 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 230 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2876  response regulator receiver  39.68 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.83 
 
 		 217 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 918 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4082  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4216  regulatory protein, LuxR  28.08 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3372  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 212 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3500  LuxR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.547243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 881 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0409  two component transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 881 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 876 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 927 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0575  hypothetical protein  22.48 
 
 		 343 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2300  hypothetical protein  24.07 
 
 		 442 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 		 210 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1237  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000317123 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1032  hypothetical protein  24.09 
 
 		 385 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.88 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1318  hypothetical protein  24.09 
 
 		 385 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.87 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3188  hypothetical protein  24.09 
 
 		 385 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1406  hypothetical protein  24.09 
 
 		 406 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  32.1 
 
 		 927 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3062  hypothetical protein  24.09 
 
 		 385 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2297  hypothetical protein  24.09 
 
 		 385 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  33.77 
 
 		 993 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1231  transcriptional regulator, LuxR family  38.78 
 
 		 441 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0692085  normal  0.545036 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3305  LuxR family DNA-binding response regulator  40 
 
 		 206 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2591  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211381  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1932  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 236 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1291  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 209 aa  43.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1870  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1249  two component LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 235 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2587  hypothetical protein  23.96 
 
 		 343 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.579093  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2451  hypothetical protein  23.96 
 
 		 343 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20460  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  31.25 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0212792  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0887  hypothetical protein  23.96 
 
 		 343 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5215  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6284  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.32 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3404  transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 427 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226025  normal  0.0787607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 218 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7524  LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  30.51 
 
 		 469 aa  42.4  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 1085 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 882 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2626  two component LuxR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.390788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0869  response regulator  32.39 
 
 		 321 aa  42.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  30.12 
 
 		 919 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5809  transcriptional regulator, LuxR family  24.21 
 
 		 235 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.962539  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0116  LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 105 aa  42.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.61 
 
 		 225 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.88 
 
 		 230 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4183  two component LuxR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 220 aa  42  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 192 aa  42  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0504  transcriptional regulator, LuxR family  33.87 
 
 		 217 aa  42  0.01  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0705101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0154  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.92 
 
 		 244 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0480  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 214 aa  42  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 461 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  35.38 
 
 		 226 aa  42  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0304  LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 282 aa  42  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  28.92 
 
 		 209 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  39.68 
 
 		 206 aa  42  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  33.87 
 
 		 225 aa  42  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>