124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2827 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2827  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 250 aa  517  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  64.75 
 
 		 250 aa  338  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4896  hypothetical protein  61.22 
 
 		 264 aa  328  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3332  SMC domain protein  60.25 
 
 		 249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3340  AAA ATPase  60.41 
 
 		 249 aa  317  9e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  61.07 
 
 		 250 aa  315  4e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4128  hypothetical protein  60.25 
 
 		 250 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3851  SMC domain-containing protein  59.84 
 
 		 250 aa  311  9e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.781388  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3764  ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4042  hypothetical protein  59.92 
 
 		 250 aa  308  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  59.5 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1110  hypothetical protein  59.5 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000880553  normal  0.123467 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3931  hypothetical protein  60.33 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00701027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4239  hypothetical protein  60.33 
 
 		 241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0948771  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2458  SMC domain-containing protein  62.04 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3779  ABC transporter, ATP-binding protein  59.17 
 
 		 241 aa  298  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.761387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1155  SMC domain protein  60.09 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3370  AAA ATPase  55.74 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0436  SMC domain protein  52.48 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0244  SMC protein-like protein  57.4 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3216  SMC domain protein  48.02 
 
 		 252 aa  224  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186823  normal  0.0902964 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0046  hypothetical protein  52.4 
 
 		 242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.275871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3710  AAA ATPase  46.49 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20730  predicted ATPase  46.26 
 
 		 236 aa  195  7e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4729  AAA ATPase  39.31 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0774125  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4387  hypothetical protein  34.52 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0842496  normal  0.0719628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1452  AAA ATPase  35.8 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.657103  normal  0.491282 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3130  AAA ATPase  41.87 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011884  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0418  AAA ATPase  38.77 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1380  hypothetical protein  37.77 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4702  AAA ATPase  37.72 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0190086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1439  AAA ATPase  32.5 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0896  AAA ATPase  33.76 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  35.46 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0899  AAA ATPase  31.71 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.938008  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1129  AAA ATPase  36.24 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1320  hypothetical protein  37.5 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.235349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1795  AAA ATPase  32.3 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.819097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1101  hypothetical protein  35.53 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00638245  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1226  AAA ATPase  33.78 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0149609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0602  SMC domain-containing protein  62.65 
 
 		 94 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0630  SMC domain-containing protein  62.65 
 
 		 94 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.881149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0634  SMC domain-containing protein  62.65 
 
 		 94 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3120  AAA ATPase  29.44 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000341201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1718  AAA ATPase  30.38 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000684443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4179  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  27.14 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.968728  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1767  ABC transporter related  26.6 
 
 		 209 aa  52  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1544  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  29.28 
 
 		 467 aa  49.7  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  52.38 
 
 		 1125 aa  48.5  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5708  ABC transporter related  26.46 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780398 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1407  ABC transporter related  25.98 
 
 		 509 aa  47.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00366651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  26.47 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3074  ABC transporter related protein  26.46 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  24.79 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  24.79 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  24.79 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  24.79 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02204  vitamin B12-transporter ATPase  26.78 
 
 		 311 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  25.79 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  25.6 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01421  ABC transporter ATP-binding protein  25.24 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3805  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  23.98 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1551  sugar ABC transporter ATP-binding protein  28.24 
 
 		 511 aa  45.8  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.048612  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1093  ABC transporter related  26.23 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000270909  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1115  ABC transporter related  26.23 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000285067  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0143  ABC transporter related  29.28 
 
 		 509 aa  45.8  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2569  ABC transporter related  26.74 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00537218  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3889  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  23.98 
 
 		 278 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  44.23 
 
 		 532 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2030  DNA repair protein RecN  51.35 
 
 		 551 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  24.79 
 
 		 506 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0315  ATPase  27.88 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.153561  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1831  ABC transporter, ATP-binding protein  29.14 
 
 		 511 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.567476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  24.79 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1591  ABC transporter related  24.74 
 
 		 478 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.243746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  23.81 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  28.69 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0402  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  25.37 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2852  ABC transporter related protein  25.32 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2377  ABC transporter related  24.47 
 
 		 252 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01391  ABC transporter ATP-binding protein  27.12 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620076  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29271  ABC transporter ATP-binding protein  23.68 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1180  heme exporter protein CcmA  25.61 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01538  ABC-type hemin transport system, ATPase component  28.86 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.554253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2805  ABC transporter related  25.6 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  22.63 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  26.37 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4414  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  32.31 
 
 		 650 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0369  ABC transporter related  22.49 
 
 		 478 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26461  ABC transporter ATP-binding protein  23.53 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.848779 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  24 
 
 		 570 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1093  ABC transporter related  27.93 
 
 		 555 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.403079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  37.31 
 
 		 482 aa  43.5  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3825  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 		 510 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.37688  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0047  ABC transporter component  29.79 
 
 		 535 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2539  ABC transporter related  25.41 
 
 		 531 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.552748 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  25.49 
 
 		 513 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  24.69 
 
 		 276 aa  43.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3838  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 		 510 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3110  ABC transporter related protein  34.55 
 
 		 581 aa  43.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.175294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>