29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4414 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4414  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  100 
 
 
650 aa  1279    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2048  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  51.71 
 
 
647 aa  647    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2908  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  50.08 
 
 
661 aa  603  1.0000000000000001e-171  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4125  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  50.7 
 
 
655 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2244  Kinetochore-Ndc80 subunit Spc25  49.92 
 
 
642 aa  585  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.182802 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0820  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  52.2 
 
 
653 aa  567  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4714  Chromosome segregation ATPase-like protein  35.37 
 
 
645 aa  352  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4890  Kinetochore-Ndc80 complex, subunit Spc25  55.21 
 
 
295 aa  281  2e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3954  Chromosome segregation ATPase-like protein  28.55 
 
 
601 aa  198  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2324  hypothetical protein  65.88 
 
 
193 aa  111  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0769  SMC domain-containing protein  21.9 
 
 
619 aa  86.3  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0350416 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  26.51 
 
 
1193 aa  66.6  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  24.11 
 
 
1021 aa  62.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0058  BPS2 protein-like protein  21.74 
 
 
587 aa  58.2  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  24.94 
 
 
864 aa  51.6  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.25 
 
 
1188 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  25.93 
 
 
1192 aa  49.7  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  21.61 
 
 
987 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  22.03 
 
 
935 aa  47  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  22.73 
 
 
1167 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  26.91 
 
 
1057 aa  46.2  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  24.84 
 
 
926 aa  45.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  25.85 
 
 
1178 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.53 
 
 
1174 aa  45.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  27.38 
 
 
891 aa  44.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  23.15 
 
 
1189 aa  44.3  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1614  Chromosome segregation ATPase-like protein  25.75 
 
 
1235 aa  44.3  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  25.1 
 
 
858 aa  43.9  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3505  Chromosome segregation ATPase-like protein  25.34 
 
 
1153 aa  43.9  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>