More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02204 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02204  vitamin B12-transporter ATPase  100 
 
 		 311 aa  643    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  38.57 
 
 		 261 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2614  vitamin B12-transporter ATPase  34.43 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1722  vitamin B12-transporter ATPase  35.29 
 
 		 252 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.630088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1830  vitamin B12-transporter ATPase  35.29 
 
 		 252 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1656  ABC transporter related  39.38 
 
 		 236 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 262 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  37.61 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  36.12 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2467  vitamin B12-transporter ATPase  39.58 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1733  vitamin B12-transporter ATPase  35.74 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2773  vitamin B12-transporter ATPase  38.67 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1627  ABC transporter related  34.85 
 
 		 256 aa  139  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01678  vitamin B12-transporter ATPase  33.19 
 
 		 249 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0384865  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01667  hypothetical protein  33.19 
 
 		 249 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0246388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1481  vitamin B12-transporter ATPase  33.19 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1789  vitamin B12-transporter ATPase  33.19 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841153  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1922  vitamin B12-transporter ATPase  33.19 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1928  vitamin B12-transporter ATPase  33.19 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000867694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1913  vitamin B12-transporter ATPase  33.19 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2427  vitamin B12-transporter ATPase  33.19 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  32.92 
 
 		 256 aa  136  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1933  ABC transporter related protein  33.19 
 
 		 249 aa  136  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0971316  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  32.92 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  34.76 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  34.05 
 
 		 262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2003  vitamin B12-transporter ATPase  32.77 
 
 		 249 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1470  vitamin B12-transporter ATPase  32.77 
 
 		 249 aa  132  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2153  vitamin B12-transporter ATPase  33.33 
 
 		 251 aa  132  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  32.74 
 
 		 267 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1831  vitamin B12-transporter ATPase  32.91 
 
 		 245 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1453  vitamin B12-transporter ATPase  32.91 
 
 		 245 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  34.33 
 
 		 265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0865  vitamin B12-transporter ATPase  34.19 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.232587  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1437  vitamin B12-transporter ATPase  32.91 
 
 		 245 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0281162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  34.36 
 
 		 260 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  32.94 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  32.05 
 
 		 264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  33.48 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3790  ABC transporter related  37.05 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00500294  normal  0.911746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  31.28 
 
 		 269 aa  127  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1310  ABC transporter related  30.71 
 
 		 254 aa  126  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 253 aa  125  7e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 255 aa  125  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2793  ABC transporter related  33.78 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4439  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.71 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  34.2 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4784  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  34.71 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4658  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 		 256 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  34.75 
 
 		 265 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  34.82 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  32.87 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4289  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 		 256 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4278  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 		 256 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118015  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1265  ABC transporter related  33.91 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  31.36 
 
 		 263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  33.88 
 
 		 256 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  33.78 
 
 		 253 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  33.33 
 
 		 419 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0077  ABC transporter related protein  33.09 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  33.63 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3559  ABC transporter related  35.55 
 
 		 242 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000437899  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  32.18 
 
 		 255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  32.72 
 
 		 259 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5060  ABC transporter related protein  34.78 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165572  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  34.07 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  32.56 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  32.92 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  32.02 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0685  ABC transporter related  37.55 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  33.49 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0670  ABC transporter related  37.55 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  32.91 
 
 		 293 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4671  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34430  ABC-type enterochelin transport system, ATPase component  35 
 
 		 252 aa  119  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2062  ABC transporter-related protein  34.22 
 
 		 266 aa  119  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  29.39 
 
 		 269 aa  119  9e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3325  ABC transporter-related protein  32.16 
 
 		 257 aa  119  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946255  normal  0.977601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  30.9 
 
 		 259 aa  119  9e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  32.27 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  32.27 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  32.27 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1766  ABC transporter related  33.92 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0708561  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  33.19 
 
 		 255 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2038  ABC transporter related protein  32.61 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003686  vitamin B12 ABC transporter ATPase component BtuD  30.8 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4499  ABC transporter related  32.07 
 
 		 271 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2875  hemin importer ATP-binding subunit  33.78 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.971494  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  36.24 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  33.88 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1178  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  32.19 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.240461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1233  ABC transporter-like protein  35.34 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.113424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01538  ABC-type hemin transport system, ATPase component  32.33 
 
 		 276 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.554253  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1933  ABC transporter related  33.47 
 
 		 272 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1610  ABC transporter related protein  35.75 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0728276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.65 
 
 		 255 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  32.33 
 
 		 536 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  36.12 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  31.86 
 
 		 257 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>