More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1722 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1722  vitamin B12-transporter ATPase  100 
 
 		 252 aa  510  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.630088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1830  vitamin B12-transporter ATPase  100 
 
 		 252 aa  510  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2614  vitamin B12-transporter ATPase  100 
 
 		 247 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2153  vitamin B12-transporter ATPase  63.6 
 
 		 251 aa  332  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2773  vitamin B12-transporter ATPase  55.65 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2467  vitamin B12-transporter ATPase  54.8 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1656  ABC transporter related  56.7 
 
 		 236 aa  261  6e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1627  ABC transporter related  51.82 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2003  vitamin B12-transporter ATPase  46.61 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1470  vitamin B12-transporter ATPase  46.61 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1453  vitamin B12-transporter ATPase  46.38 
 
 		 245 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1481  vitamin B12-transporter ATPase  45.99 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1922  vitamin B12-transporter ATPase  45.99 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1437  vitamin B12-transporter ATPase  46.38 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0281162 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1831  vitamin B12-transporter ATPase  45.96 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1789  vitamin B12-transporter ATPase  45.99 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1928  vitamin B12-transporter ATPase  45.99 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000867694  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1913  vitamin B12-transporter ATPase  45.99 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2427  vitamin B12-transporter ATPase  45.99 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516886  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01678  vitamin B12-transporter ATPase  45.99 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0384865  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01667  hypothetical protein  45.99 
 
 		 249 aa  211  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0246388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1933  ABC transporter related protein  45.57 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0971316  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1733  vitamin B12-transporter ATPase  46.84 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0865  vitamin B12-transporter ATPase  44.21 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.232587  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003686  vitamin B12 ABC transporter ATPase component BtuD  40.24 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02133  vitamin B12-transporter ATPase  40.34 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02204  vitamin B12-transporter ATPase  35.29 
 
 		 311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  35.29 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  36.17 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  31.85 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0584  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  30.67 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 258 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1391  ABC transporter related  33.73 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.089837  normal  0.759969 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  33.47 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4653  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 258 aa  112  8.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  33.76 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4668  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  30.87 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04153  iron-dicitrate transporter subunit  34.16 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3713  ABC transporter related protein  34.16 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  33.61 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0690  ABC transporter related  31.75 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4864  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  34.16 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04116  hypothetical protein  34.16 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  34.36 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4372  ABC transporter related  29.72 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4658  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  29.72 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4439  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  29.72 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4289  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  30.2 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4784  iron compound ABC transporter ATP-binding protein  29.72 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  35.62 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  34.19 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  36.15 
 
 		 270 aa  109  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1102  ABC transporter related  33.6 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.75 
 
 		 402 aa  109  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4278  ferrichrome ABC transporter, ATP-binding protein  29.72 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.118015  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0739  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  33.74 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4671  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  29.39 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  36.52 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  34.08 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  34.09 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.04 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2421  ABC transporter related  34.09 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00390383  normal  0.0144872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0664  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  33.63 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1437  ABC Fe+3 hydroxamate (ferrichrome) transporter, ATPase subunit  33.98 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  34.8 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  35.62 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  33.19 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  35.62 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3529  ABC transporter related  30.62 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0402  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  27.85 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  31.25 
 
 		 424 aa  106  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  36.09 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  33.18 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  26.8 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0760  iron(III) dicitrate transport system, ATP-binding protein FecE  33.63 
 
 		 263 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01538  ABC-type hemin transport system, ATPase component  33.78 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.554253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2501  ABC transporter related  33.33 
 
 		 534 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  35.15 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  31.43 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2803  ABC transporter related  31.4 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  33.92 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  29.29 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4079  ABC transporter related  33.07 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  27.13 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.13 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1258  ABC transporter related  30.4 
 
 		 412 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  36.25 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1352  ABC transporter related  29.41 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  35.4 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  32.72 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  35.4 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  35.4 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  26.8 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>