More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02133 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02133  vitamin B12-transporter ATPase  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003686  vitamin B12 ABC transporter ATPase component BtuD  82.28 
 
 		 254 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0865  vitamin B12-transporter ATPase  54.51 
 
 		 251 aa  267  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.232587  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1627  ABC transporter related  41.5 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2003  vitamin B12-transporter ATPase  41.5 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.411069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1470  vitamin B12-transporter ATPase  41.5 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.965891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1831  vitamin B12-transporter ATPase  41.67 
 
 		 245 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1453  vitamin B12-transporter ATPase  41.67 
 
 		 245 aa  178  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1437  vitamin B12-transporter ATPase  41.67 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0281162 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1789  vitamin B12-transporter ATPase  38.74 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841153  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1481  vitamin B12-transporter ATPase  38.74 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1922  vitamin B12-transporter ATPase  38.74 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1913  vitamin B12-transporter ATPase  38.58 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1928  vitamin B12-transporter ATPase  38.74 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000867694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01678  vitamin B12-transporter ATPase  38.74 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0384865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1933  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0971316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01667  hypothetical protein  38.74 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0246388  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2427  vitamin B12-transporter ATPase  38.34 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.516886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2153  vitamin B12-transporter ATPase  38.34 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1656  ABC transporter related  41.6 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.502548  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1830  vitamin B12-transporter ATPase  40.34 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1722  vitamin B12-transporter ATPase  40.34 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.630088  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2614  vitamin B12-transporter ATPase  40.34 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2773  vitamin B12-transporter ATPase  40.08 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1733  vitamin B12-transporter ATPase  37.94 
 
 		 251 aa  161  7e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2467  vitamin B12-transporter ATPase  38.34 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.530396  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  34.5 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  35.54 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  34.24 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  33.61 
 
 		 264 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  33.33 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  34.96 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  32.78 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  36.24 
 
 		 261 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  40.87 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  33.89 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  34.48 
 
 		 536 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  32.74 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  35.95 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  40.43 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0455  hemin importer ATP-binding subunit  32.61 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.341265  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4194  ABC transporter related  35.57 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.089861  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  39.56 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  33.33 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  37.33 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  34.15 
 
 		 254 aa  109  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  37.96 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2733  Fe(III) dicitrate ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000467134  hitchhiker  0.000159988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  31.87 
 
 		 268 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  37.1 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  34.44 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4205  hemin importer ATP-binding subunit  32.52 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  36.11 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2665  ABC transporter related  35.51 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  30.29 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  36.89 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  32.44 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  30.3 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0343  hemin importer ATP-binding subunit  34.68 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  32.48 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  29.81 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  33.62 
 
 		 490 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  29.61 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2331  ABC transporter-related protein  31.9 
 
 		 255 aa  105  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  32.64 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  30.22 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01538  ABC-type hemin transport system, ATPase component  30.56 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.554253  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1289  hypothetical protein  31.09 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.128877 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1426  ABC transporter related  32.37 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.883261  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  26.4 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  30.68 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  29.88 
 
 		 282 aa  102  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  33.98 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  34.62 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0851  ABC transporter related  31.28 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.317375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02204  vitamin B12-transporter ATPase  27.2 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1603  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.51 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  35.32 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1788  hemin ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.51 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.193205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2397  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0465  ABC-type transport systems, ATPase components  30.87 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1212  ABC transporter related  31.08 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  33.89 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  31.93 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3430  ABC transporter related  34.53 
 
 		 530 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.618683  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1712  ABC transporter related  31.45 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  29.39 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  31.28 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  32.91 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4834  hemin importer ATP-binding subunit  30.71 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  35.27 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5427  hemin importer ATP-binding subunit  30.71 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1298  iron chelate ABC transporter ATP-binding protein  30.27 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0252271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1117  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.27 
 
 		 251 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.606006  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4776  hemin importer ATP-binding subunit  30.57 
 
 		 273 aa  99.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5435  hemin importer ATP-binding subunit  30.71 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.385416  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2251  ABC transporter related  31.08 
 
 		 250 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309899 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  32.46 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  30.58 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>