More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0522 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
391 aa  807    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  41.41 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 
367 aa  187  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  40.17 
 
 
326 aa  186  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  33.12 
 
 
348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  33.96 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  37.58 
 
 
363 aa  182  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  41.84 
 
 
388 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  31.63 
 
 
328 aa  177  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  38.34 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  32.92 
 
 
335 aa  173  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  32.93 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  38.55 
 
 
332 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  47.03 
 
 
369 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  38.55 
 
 
332 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  32.31 
 
 
338 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  32.18 
 
 
328 aa  170  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  35.86 
 
 
369 aa  170  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  44.97 
 
 
323 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  44.97 
 
 
323 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  37.82 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  38.29 
 
 
405 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  33.15 
 
 
401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  32.17 
 
 
328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  35.83 
 
 
322 aa  164  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  39.15 
 
 
322 aa  163  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  39.34 
 
 
355 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  37.08 
 
 
390 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  44.19 
 
 
352 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  29.82 
 
 
329 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  29.82 
 
 
329 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  30.86 
 
 
328 aa  160  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  31.01 
 
 
335 aa  160  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  32.63 
 
 
322 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  30.28 
 
 
336 aa  159  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  38.72 
 
 
360 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  31.02 
 
 
335 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  37.1 
 
 
387 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  34.8 
 
 
389 aa  156  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  42.78 
 
 
366 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  31.9 
 
 
308 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  30.69 
 
 
335 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  29.7 
 
 
332 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  30.15 
 
 
330 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  29.62 
 
 
327 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  29.62 
 
 
327 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  35.83 
 
 
325 aa  153  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  39.48 
 
 
425 aa  153  5e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  35 
 
 
388 aa  153  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  32.7 
 
 
336 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  30.3 
 
 
327 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  30.7 
 
 
336 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  32.85 
 
 
336 aa  149  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  31.43 
 
 
336 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  27.44 
 
 
327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  32.81 
 
 
325 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  27.88 
 
 
328 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  40 
 
 
239 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  30.41 
 
 
321 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  36.49 
 
 
428 aa  138  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  35.34 
 
 
493 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  37.09 
 
 
477 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  36.7 
 
 
430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  35.12 
 
 
427 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  35.97 
 
 
419 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  36.74 
 
 
424 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  37.38 
 
 
425 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  31.82 
 
 
328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  34.42 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  35.56 
 
 
468 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  38.27 
 
 
243 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  36.74 
 
 
419 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  33.64 
 
 
426 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  34.76 
 
 
459 aa  126  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  27.96 
 
 
332 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  29.87 
 
 
814 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  31.25 
 
 
930 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  35.75 
 
 
829 aa  117  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.02 
 
 
723 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.19 
 
 
759 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  33.85 
 
 
804 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  34.03 
 
 
721 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  32.62 
 
 
806 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.91 
 
 
769 aa  112  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.65 
 
 
784 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.24 
 
 
781 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  33.84 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.1 
 
 
718 aa  110  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.38 
 
 
781 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  29.45 
 
 
379 aa  109  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  29.03 
 
 
570 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  29.03 
 
 
570 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.84 
 
 
768 aa  109  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.29 
 
 
740 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  29.03 
 
 
570 aa  109  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.24 
 
 
800 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  29.52 
 
 
810 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.28 
 
 
742 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.9 
 
 
760 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  31.71 
 
 
577 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>