More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0942 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0942  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 621 aa  1292    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0869  extracellular solute-binding protein  44.03 
 
 		 626 aa  507  9.999999999999999e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00641  ABC oligopeptide transporter periplasmic component  41.67 
 
 		 609 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001852  ABC-type dipeptide transport system component  41.91 
 
 		 608 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02855  hypothetical protein  39.09 
 
 		 615 aa  452  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003025  ABC-type dipeptide transport system component  38.58 
 
 		 612 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.561815  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1853  extracellular solute-binding protein family 5  34.11 
 
 		 734 aa  348  2e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1685  extracellular solute-binding protein family 5  31.26 
 
 		 668 aa  299  1e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0732988  normal  0.758738 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0985  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  30.35 
 
 		 645 aa  281  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00011806  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0988  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, peptide-binding protein  26.86 
 
 		 647 aa  199  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.356739  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  27.77 
 
 		 622 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  26.78 
 
 		 546 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2153  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 597 aa  144  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  25.53 
 
 		 540 aa  140  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1104  extracellular solute-binding protein family 5  23.51 
 
 		 622 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 539 aa  132  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 		 619 aa  130  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 559 aa  127  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0393  extracellular solute-binding protein family 5  24.58 
 
 		 658 aa  126  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.305694  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3867  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 621 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3716  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.37 
 
 		 609 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 538 aa  124  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0448  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.08 
 
 		 628 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1538  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 609 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1214  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 627 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.454357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2128  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 603 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.603606  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1759  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.358749  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.14 
 
 		 538 aa  118  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3166  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 615 aa  118  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3485  putative solute-binding protein  22.65 
 
 		 626 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3093  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 		 640 aa  118  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311181 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2741  extracellular solute-binding protein family 5  23.19 
 
 		 598 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.982648  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1237  extracellular solute-binding protein  21.49 
 
 		 622 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.469932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1916  extracellular solute-binding protein family 5  22.86 
 
 		 602 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3472  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1348  extracellular solute-binding protein family 5  23.13 
 
 		 603 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0798387  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2094  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 627 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2060  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 615 aa  114  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163136  normal  0.391933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3120  extracellular solute-binding protein  22.55 
 
 		 617 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821712 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1810  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 624 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0607685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1964  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 627 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1918  extracellular solute-binding protein family 5  23.27 
 
 		 624 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41110  putative solute-binding protein  22.07 
 
 		 609 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2129  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 627 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.641802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 524 aa  111  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1383  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 640 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3073  extracellular solute-binding protein  22.47 
 
 		 622 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.21 
 
 		 534 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3471  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 		 609 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.640162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1539  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 617 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.738539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.91 
 
 		 534 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0514  extracellular solute-binding protein family 5  22.79 
 
 		 617 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.772903  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1719  extracellular solute-binding protein  21.5 
 
 		 646 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.244782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4147  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  23.27 
 
 		 611 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0244  ABC transporter substrate binding protein (peptide)  23.43 
 
 		 631 aa  109  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3029  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.71 
 
 		 622 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.778411  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  24.16 
 
 		 576 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 567 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0288  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 631 aa  109  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34340  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.49 
 
 		 562 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144528  normal  0.124622 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4084  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 622 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37880  putative binding protein component of ABC transporter  22.97 
 
 		 602 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00173754  normal  0.230207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4146  peptide ABC transporter, periplamic peptide-binding protein  21.5 
 
 		 609 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  24.15 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 618 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3719  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 		 611 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0280101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3639  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 		 641 aa  108  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.294463  normal  0.053682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2061  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 616 aa  108  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409615  normal  0.170665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41130  putative binding protein component of ABC transporter  21.92 
 
 		 615 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1607  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.1 
 
 		 650 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00266452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2902  extracellular solute-binding protein  22.41 
 
 		 622 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19921  normal  0.272453 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1382  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.1 
 
 		 650 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3204  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.1 
 
 		 650 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0292064  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3718  extracellular solute-binding protein  21.5 
 
 		 590 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2635  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.41 
 
 		 686 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.63534  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2501  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 		 613 aa  107  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0677964  normal  0.0181569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1718  extracellular solute-binding protein  23.27 
 
 		 611 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.359306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4858  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.02 
 
 		 531 aa  107  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185299  normal  0.554017 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2547  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.41 
 
 		 650 aa  107  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.524722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  23.73 
 
 		 567 aa  107  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 575 aa  107  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0289  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 606 aa  107  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  22.7 
 
 		 498 aa  106  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4153  ABC transporter substrate-binding protein  25.49 
 
 		 601 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2081  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 624 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2182  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 		 610 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2109  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.1 
 
 		 936 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.556934  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1616  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 621 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.320311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1636  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  23.81 
 
 		 654 aa  106  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.106746  normal  0.365226 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2146  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 661 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0180  extracellular solute-binding protein family 5  22.26 
 
 		 607 aa  105  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0115715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2632  extracellular solute-binding protein  22.5 
 
 		 638 aa  105  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6015  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 624 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2493  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.21 
 
 		 650 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409062  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  22.4 
 
 		 551 aa  105  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1645  extracellular solute-binding protein family 5  21.63 
 
 		 602 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.819399  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2062  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 624 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2336  extracellular solute-binding protein family 5  21.75 
 
 		 603 aa  104  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1108  extracellular solute-binding protein family 5  22.44 
 
 		 628 aa  104  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.762365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>