219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0806 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0806  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 462 aa  934    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  27.85 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  29.71 
 
 		 431 aa  100  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  29.38 
 
 		 431 aa  95.9  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1470 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 460 aa  94  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  24.2 
 
 		 453 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  25.83 
 
 		 455 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.42 
 
 		 1496 aa  87.8  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  25.5 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  26.94 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1773  outer membrane efflux protein  23.1 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  26.5 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  25.28 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2559  outer membrane efflux protein  24.29 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  25.27 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  23.77 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  28.18 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.3 
 
 		 491 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3496  outer membrane efflux protein  25.86 
 
 		 565 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1353  outer membrane efflux protein  19.33 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.678572  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 		 635 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.22 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.4 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  26.09 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  24.54 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  23.42 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 731 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  21.99 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1779  outer membrane efflux protein  28.38 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.66 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  25.16 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.21 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  23.94 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  25.81 
 
 		 470 aa  67  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  24.12 
 
 		 455 aa  67  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 463 aa  67  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  23.14 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.65 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  23.87 
 
 		 482 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.11 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.95 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0791  outer membrane efflux protein  25.63 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.670065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  23.04 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  22.35 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  20.54 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0559  outer membrane efflux protein  22.52 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  25.56 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4902  outer membrane efflux protein  21.7 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  22.76 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  23.87 
 
 		 470 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0863  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0409869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  24.56 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  21.18 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  23.37 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 578 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  24.86 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  26.1 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  20.76 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.84 
 
 		 497 aa  57.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  24.24 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  20.51 
 
 		 443 aa  57  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 447 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2428  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.14 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.440095 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  25.7 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0171  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.25 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.62 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>