More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0336 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0336  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 330 aa  692    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2018  beta-lactamase domain-containing protein  52.56 
 
 		 296 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2888  beta-lactamase domain protein  36.21 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3638  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4715  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515009  decreased coverage  0.00436912 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1067  hypothetical protein  32.51 
 
 		 309 aa  149  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.21331  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2918  beta-lactamase domain protein  31.94 
 
 		 305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1061  Zn-dependent hydrolases including glyoxylases-like protein  26.17 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1429  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  33.55 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  29.17 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.51 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  30.69 
 
 		 206 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  31.61 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  31.65 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  26.83 
 
 		 329 aa  69.3  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2843  beta-lactamase-like protein  37.5 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  34.75 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  30.26 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  30.67 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  35.39 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  27.92 
 
 		 217 aa  67  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1178  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  28.35 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1619  zinc-dependent hydrolase  26.37 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  29.68 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  33.09 
 
 		 209 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  30.92 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.77 
 
 		 216 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 		 235 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  30.16 
 
 		 204 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  30.05 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  27.6 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  27.34 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  32.26 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  32.77 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.733457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  32.3 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  31.07 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46150  hypothetical protein  28.89 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2620  beta-lactamase domain-containing protein  28.3 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  31.25 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  28.42 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1772  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.32284 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  30.32 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  29.05 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  23.4 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3924  hypothetical protein  28.44 
 
 		 242 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.556036  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  33.96 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 		 240 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  30.81 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  25.97 
 
 		 337 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  31.49 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  34.03 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.97 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.4 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.4 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.4 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2138  beta-lactamase-like  27.27 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0796003  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.4 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.4 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0536  beta-lactamase domain protein  32.39 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0161694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  33.11 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  27.92 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  28.81 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  28.12 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.04 
 
 		 208 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  31.48 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  30.97 
 
 		 200 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  27.86 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  27.5 
 
 		 215 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  30.16 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  29.49 
 
 		 212 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  31.97 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3001  beta-lactamase domain protein  31.95 
 
 		 568 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3691  beta-lactamase domain-containing protein  31.95 
 
 		 568 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.781768  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  33.81 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  30.72 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  29.1 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  31.03 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0692  beta-lactamase domain-containing protein  26.98 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  29.38 
 
 		 304 aa  57  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  33.09 
 
 		 218 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  25.9 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  30.77 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  30.38 
 
 		 324 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  26.88 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  30.71 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  29.11 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  25.86 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>