73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2948 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  100 
 
 		 841 aa  1730    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  30.64 
 
 		 845 aa  333  1e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  31.19 
 
 		 843 aa  305  2.0000000000000002e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  29.68 
 
 		 866 aa  256  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.8 
 
 		 861 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  23.36 
 
 		 874 aa  92.8  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  23.28 
 
 		 809 aa  83.2  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  22.14 
 
 		 847 aa  82.8  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.34 
 
 		 608 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  22.95 
 
 		 860 aa  80.1  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  21.91 
 
 		 864 aa  76.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.05 
 
 		 811 aa  74.3  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  22.87 
 
 		 841 aa  73.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.28 
 
 		 631 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.22 
 
 		 792 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  23.39 
 
 		 815 aa  72  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  21.69 
 
 		 855 aa  70.5  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  21.34 
 
 		 815 aa  70.1  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  21.69 
 
 		 855 aa  70.1  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.15 
 
 		 629 aa  68.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.24 
 
 		 595 aa  68.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  22.98 
 
 		 858 aa  67.8  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  21.14 
 
 		 819 aa  67.4  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  23.04 
 
 		 864 aa  67  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  22.65 
 
 		 815 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.96 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  22.15 
 
 		 827 aa  64.7  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.32 
 
 		 1043 aa  64.7  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  21.11 
 
 		 868 aa  64.3  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  22.92 
 
 		 866 aa  62.4  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.35 
 
 		 630 aa  62  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.1 
 
 		 815 aa  62  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  20.67 
 
 		 690 aa  61.6  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3330  hypothetical protein  22.36 
 
 		 913 aa  61.6  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.543175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3424  hypothetical protein  24.2 
 
 		 956 aa  60.1  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.04 
 
 		 657 aa  58.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  21.43 
 
 		 776 aa  58.9  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6709  hypothetical protein  21.87 
 
 		 845 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.534859  normal  0.161214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2948  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  22.96 
 
 		 913 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0435  hypothetical protein  23.13 
 
 		 949 aa  54.3  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.544746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1398  hypothetical protein  23.16 
 
 		 955 aa  53.5  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  21.49 
 
 		 908 aa  53.9  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  21.01 
 
 		 875 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1184  hypothetical protein  23.13 
 
 		 955 aa  53.9  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1626  hypothetical protein  24.25 
 
 		 949 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3023  hypothetical protein  26.17 
 
 		 917 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2394  hypothetical protein  23.39 
 
 		 962 aa  52.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0683  hypothetical protein  22.2 
 
 		 960 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.439939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  20.39 
 
 		 837 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0502  hypothetical protein  24.79 
 
 		 978 aa  52  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  25.14 
 
 		 908 aa  51.2  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.91 
 
 		 836 aa  51.2  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2353  hypothetical protein  23.03 
 
 		 963 aa  51.2  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000463521  unclonable  0.00000047318 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1256  hypothetical protein  23.09 
 
 		 963 aa  51.2  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0948  hypothetical protein  23.76 
 
 		 962 aa  50.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.711504  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4179  hypothetical protein  22.43 
 
 		 969 aa  50.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0837304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0337  putative plasmid-related protein  20.21 
 
 		 952 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.92337  normal  0.715711 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2186  hypothetical protein  23.54 
 
 		 962 aa  49.7  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  19.37 
 
 		 747 aa  49.3  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  20.82 
 
 		 616 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4086  putative plasmid-related protein  22.64 
 
 		 954 aa  49.7  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  20.71 
 
 		 609 aa  49.3  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59940  hypothetical protein  21.25 
 
 		 980 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.163365  hitchhiker  0.00000000104179 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4169  putative plasmid-related protein  24.18 
 
 		 954 aa  48.1  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.660111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  18.55 
 
 		 659 aa  48.1  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  22.53 
 
 		 663 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  22.19 
 
 		 569 aa  46.6  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  21.14 
 
 		 610 aa  46.6  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  19.8 
 
 		 865 aa  46.6  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  22.31 
 
 		 819 aa  45.8  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1022  hypothetical protein  20.63 
 
 		 916 aa  44.7  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1060  hypothetical protein  20.63 
 
 		 916 aa  44.7  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  20.63 
 
 		 924 aa  44.3  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>