More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1543 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.67 
 
 
1734 aa  1325    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.16 
 
 
1698 aa  995    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.78 
 
 
1754 aa  895    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.44 
 
 
1711 aa  1026    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  36.91 
 
 
1704 aa  917    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  100 
 
 
1711 aa  3533    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.67 
 
 
1723 aa  1303    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.76 
 
 
1770 aa  1230    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.18 
 
 
1743 aa  1246    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.63 
 
 
1719 aa  884    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.7 
 
 
1725 aa  935    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.2 
 
 
1741 aa  1306    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.8 
 
 
1723 aa  892    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.8 
 
 
1672 aa  905    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.65 
 
 
1765 aa  1092    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.39 
 
 
1722 aa  1355    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.1 
 
 
1695 aa  1091    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  30.1 
 
 
1838 aa  522  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.04 
 
 
1764 aa  310  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  50.23 
 
 
321 aa  212  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.46 
 
 
1525 aa  177  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.22 
 
 
1543 aa  163  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.22 
 
 
1543 aa  163  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.5 
 
 
1542 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.89 
 
 
1602 aa  155  8e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  34.37 
 
 
1561 aa  154  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.18 
 
 
1607 aa  154  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.33 
 
 
2099 aa  153  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  35.49 
 
 
2087 aa  145  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  38.71 
 
 
2082 aa  140  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  28.26 
 
 
1578 aa  140  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  30.28 
 
 
2124 aa  138  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.95 
 
 
2136 aa  131  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  28.16 
 
 
2125 aa  129  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  43.65 
 
 
2224 aa  129  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.31 
 
 
1589 aa  129  6e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.63 
 
 
2113 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  28.49 
 
 
2093 aa  127  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.09 
 
 
2120 aa  125  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.86 
 
 
2213 aa  124  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.07 
 
 
2113 aa  124  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.37 
 
 
2113 aa  123  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  35.37 
 
 
2113 aa  123  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  29.56 
 
 
1784 aa  122  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.56 
 
 
1861 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.71 
 
 
2104 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  35.71 
 
 
2104 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.71 
 
 
2104 aa  117  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  26.57 
 
 
1422 aa  117  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  27.36 
 
 
2106 aa  116  5e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.68 
 
 
685 aa  114  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.32 
 
 
2104 aa  112  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  30.24 
 
 
459 aa  112  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  27.09 
 
 
1780 aa  106  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.44 
 
 
962 aa  103  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  36.15 
 
 
912 aa  97.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.32 
 
 
1787 aa  97.1  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.78 
 
 
1759 aa  96.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.07 
 
 
972 aa  94.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  36.16 
 
 
2097 aa  94.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.88 
 
 
1741 aa  92.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.54 
 
 
1740 aa  92  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.22 
 
 
941 aa  92  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.75 
 
 
959 aa  89.4  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.81 
 
 
764 aa  89  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.14 
 
 
790 aa  89  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.07 
 
 
762 aa  88.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.59 
 
 
1053 aa  88.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  32.64 
 
 
758 aa  87.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.13 
 
 
1198 aa  87.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.19 
 
 
803 aa  86.7  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.34 
 
 
897 aa  86.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.24 
 
 
744 aa  86.7  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.87 
 
 
685 aa  86.7  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
807 aa  86.3  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.72 
 
 
739 aa  85.5  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.52 
 
 
815 aa  85.5  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  33.33 
 
 
986 aa  84.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.88 
 
 
751 aa  85.1  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.1 
 
 
740 aa  84.7  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.81 
 
 
759 aa  83.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  30.29 
 
 
905 aa  83.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.44 
 
 
1086 aa  83.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
973 aa  82.8  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35 
 
 
789 aa  82.4  0.00000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.36 
 
 
808 aa  80.5  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.11 
 
 
815 aa  80.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.2 
 
 
744 aa  80.1  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  32.31 
 
 
815 aa  80.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.45 
 
 
751 aa  79.7  0.0000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  28.78 
 
 
1178 aa  79.3  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.65 
 
 
744 aa  79  0.0000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0202  DEAD/H associated domain protein  32.97 
 
 
841 aa  79  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.59 
 
 
756 aa  78.6  0.0000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.000031195  normal  0.342253 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  34.36 
 
 
1210 aa  78.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.12 
 
 
815 aa  77.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.2 
 
 
744 aa  77.8  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0232  DEAD/H associated domain protein  32.42 
 
 
853 aa  77.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.91 
 
 
758 aa  77.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  30.32 
 
 
906 aa  77  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>